آنالیز بیوانفورماتیکی توالی پروتئینی Hsp 90 در بین گونه های مختلف راسته Saccharomycetales بر اساس داده کاوی
Publish place: 8th national biotechnology congress of I.R. Iran & 4th National Conference on biosecurity
Publish Year: 1392
Type: Conference paper
Language: Persian
View: 814
This Paper With 6 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
Export:
Document National Code:
NBCI08_0949
Index date: 20 September 2015
آنالیز بیوانفورماتیکی توالی پروتئینی Hsp 90 در بین گونه های مختلف راسته Saccharomycetales بر اساس داده کاوی abstract
مخمرهای راسته Saccharomycetales توانایی تحمل شرایط نامساعد گرمایی و تولید پروتئین شوک حرارتی را دارند .در این برریس توالیاسید آمینه مربوط به پروتئینهای شوک حرارتی (Hsp90) گونه هایی از این راسته از بانک زن استخراج و توسط نرم افزار MEG5 مقایسه شدند . نتایج آنالیز با روش NJ، تمامی گونه ها را با تفاوت های نسبی در یک گروه قرار داد و گونه Lodderomyces elongisporus به عنوان برون گروه انتخاب شد. سپس توالیهای پروتئین همردیف و مورد آنالیز دومین قرار گرفتند که بر اساس نتایج همه توالیها دارای دومین های HATPase ( Histidine kinase-like ATPases و( HSP(Multi domin بودند ، همچنین بر اساس همردیفی اسید آمینه مشخص گردید که در داخل هر کلاد حداقل مقدار اختلاف در اسید آمینه وجود دارد که صحت دندورگرام حاصل را نشان می دهد ، توالی پروتئین Hsp90 از گونه Saccharomyces cerevisiae توسط نرم افزار CLCbio آنالیز گردید ، این پروتئین دارای وزن ملکولی 88/92 کیلودالتون و نقطه ایزوالکتریک 5/05 بود و بر اساس نمودار هیدروفوبیستی بیشترین میزان هیدروفویی در فاصله آمینواسید 100 تا 110 واقع شده است ، می توان بیان داشت که د رقسمت بیرونی پروتئین قرار داردند .
آنالیز بیوانفورماتیکی توالی پروتئینی Hsp 90 در بین گونه های مختلف راسته Saccharomycetales بر اساس داده کاوی Keywords:
آنالیز بیوانفورماتیکی توالی پروتئینی Hsp 90 در بین گونه های مختلف راسته Saccharomycetales بر اساس داده کاوی authors
پریسا رزاقی
دانشجوی دکتری قارچ شناسی، گروه گیاه دانشگاه بوعلی سینا همدان
سحر لیلایی
دانشجوی دکتری قارچ شناسی، گروه گیاه دانشگاه بوعلی سینا همدان
میترا عباسی
دانشجوی دکتری قارچ شناسی، گروه گیاه دانشگاه بوعلی سینا همدان
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :