مقایسه صحت پیش بینی ارزش های اصلاحی GBLUP و RRBLUP براساس داده های ژنومی

انتخاب ژنومیک در حال حاضر در برخی برنامه های اصلاح نژادی دنیا در حال اجرا است با این وجود هنوز مشکلاتی دامنگیر این تکنولوژی است از جمله مطابقت دادن برنامه های ارزیابی ملی با اطلاعات ژنومیک ، انتخاب بین نژادها ،نحوه مدیریت پیشرفت ژنتیکی در طولانی مدت، کنترل هم خونی و مشکلات محاسباتی. به این منظور ژنومی به طول 10 مورگان و تعداد 10 کروموزوم با طول یکسان 1 مورگان شبیه سازی شد. تعداد مارکر بر روی هر کروموزوم 1000 عدد درنظر گرفته شد ، تعداد 200 QTL بطور تصادفی بر روی کل سطح ژنوم پخش شدند . جمعیت شبیه سازی شده شامل اندازهجمعیت موثر نسل پایه 100 حیوان ) 50 نر و 50 ماده( غیر خویشاوند و 50 نسل آمیزش بصورت کاملاً تصادفی جهت ایجادعدم تعادل پیوستگی بین جایگاهها در نظر گرفته شد. جمعیت مرجع را نسل های 51 تا 67 تشکیل داد . برای حیوانات نسل51 تا 67 یک ارزش فنوتیپی شبیه سازی گردید و در نتیجه این حیوانات هم دارای رکورد فنوتیپی و هم ژنوتیپی می باشند.در همه نسل های 52 تا 67 ارزیابی و انتخاب حیوانات برای حیوانات جوان فاقد فنوتیپ صورت گرفت . ارزش های اصلاحی افراد با استفاده از روش BLUP برآورد گردید .نتایج مشاهده شده نشان داد که بیشترین میزان دقت برای روش RRBLUP و کمترین میزان دقت برای روش GBLUP می باشد . از مقایسه نتایج به دست آمده با نتایج سایر مطالعات صورت گرفته این نتیجه حاصل شد که انتخاب یک مدل مناسب برای تمامی شرایط غیر ممکن خواهد بود چراکه عوامل مختلفی دقت انتخابانواع روش ها را تحت تاثیر قرار می دهند

Keywords:

عدم تعادل پیوستگی , دقت انتخاب , نشانگر , شبیه سازی , BLUP