مدلسازی شبکه های تنظیم کننده ژنی با استفاده از شبکه های بیزی دینامیک
Publish place: The Second National Conference on New Approaches in Computer and Electrical Engineering
Publish Year: 1395
Type: Conference paper
Language: Persian
View: 954
This Paper With 6 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
Export:
Document National Code:
BPJ02_204
Index date: 1 November 2016
مدلسازی شبکه های تنظیم کننده ژنی با استفاده از شبکه های بیزی دینامیک abstract
کشف فعل و انفعالات بین ژنها یکی از مسائل کلیدی در درک رفتار سلولی است. مدلسازی شبکه های تنظیم کننده زنی می تواند در بسیاری از کاربردهای پزشکی و بیولوژی مولکولی مانند تشخیص مسیرهای متابولیکی و کشف دارو مورد استفاده قرار می گیرد. شناسایی این شبکه ها از داده های سری زمانی میکرو آرایه یکی از مسائل کلیدی در بیوانفورماتیک است. تاکنون روش های مختلفی برای مدلسازی شبکه های تنظیم کننده ژنی از داده های سری زمانی میکروآرایه ارائه شده است. با توجه به ماهیت تصادفی داده های میکروآرایه و ماهیت احتمالاتی شبکه های بیزی دینامیک ،در این مقاله از این روش برای مدلسازی روابط علی بین ژنها استفاده شده است. این شبکه ها توانایی کار با متغیرهای پیوسته (متغیرهایی که به دو یا چند سطح گسسته سازی نشده اند) را دارند و بنابراین قادر به اخذ اطلاعات زمانی و مدلسازی پدیده های وابسته به زمان می باشند. در این مقاله برای سازگاری مدل با وابستگی غیرخطی بین متغیرها از مدل تعمیم یافته شبکه های گوسی استفاده شده است. همچنین برای جستجو در فضای ساختارها از روش جستجوی اکتشافی k2 استفاده شده است. در بسیاری از کارهایی که از این شبکه ها برای مدلسازی شبکه های ژنتیکی استفاده شده ، تاخیر زمانی مرتبه اول ( فرض مارکوف مرتبه اول ) در مورد ارتباطات بین ژنها در نظر گرفته شده است و ما نیز در این مقاله این فرض را لحاظ کرده ایم .
مدلسازی شبکه های تنظیم کننده ژنی با استفاده از شبکه های بیزی دینامیک Keywords:
بیوانفورماتیک , شبکه های تنظیم کننده ی ژنی , داده های سری زمانی میکروآرایه , شبکه های بیزی دینامیک , الگوریتم k2
مدلسازی شبکه های تنظیم کننده ژنی با استفاده از شبکه های بیزی دینامیک authors
علیرضا قهرمانی برندق
گروه مهندسی پزشکی ، واحد تبریز، دانشگاه آزاد اسلامی، تبریز، ایران
سیامک حقی پور
گروه مهندسی پزشکی ، واحد تبریز، دانشگاه آزاد اسلامی، تبریز، ایران
حنیف یعقوبی
گروه مهندسی پزشکی ، واحد علوم و تحقیقات ، دانشگاه آزاد اسلامی ، تهران ، ایران،
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :