مروری بر تطبیق دنباله های زیستی با استفاده از FPGA

هدق از تطیبیق دنیاله های زیستی، پیدا کردن نواحی شیبیه یه هم در دنیاله ها می یاشد که ممکن است ساختار تکاملی مشترک و یا یک ناحیه عملیاتی یکسانی داشته یاشند. دنیاله های زیستی شامل DNA پروتئین و RNA می باشند. یا استفاده از تطبیق دنیاله های زیستی می توان یه وجود بیماری، کشف دارو و بهینه سازی دارو پی یرد. سرعت و دقت یرای مسئله تطبیق دنیاله های زیستی یسیار مهم می یاشد. روش های ترم اقزاری یرای تطیبیق دنیاله های زیستی دارای سرعت پایین می یاشند و دقت جوابی نرم اقزارها 100 درصد نمی یاشد و درصدی از تقریبی می یاشد. استغاده از قطعه FPGA یاعت می شود که سرعت تطییق دنیاله های زیستی اقزایش چشمگیری داشته یاشد و همچنین دقت آن 100 درصد می یاشد. در این پژوهشی، مروری یر کارهای انجام شده یرای مسئله تطیبیق دنیاله های زیستی یا استغاده از FPGA انجام داده ایم. پژوهش انجام شده شامل یررسی مزایا و معایی پیاده سازی انواع الگوریتم ها و سخت اقزارهای طراحی شده یرای مسئله تطیبیق دنیاله های زیستی یا استفاده از FPGA می یاشد.

Keywords:

تعلیق دنیاله زیستی , ژن , FPGA پیاده سازی , الگوریتم , بهینه سازی