شناسایی مناطق ژنومی مرتبط با قطر پشم در نژادهای گوسفند ایرانی

هدف از این پژوهش پویش ژنوم گوسفند برای شناسایی جایگاه های موثر بر قطر پشم در نژادهای بومی کشور بود. برای این منظور نمونه های خون 34 حیوان، شامل 44 راس از نژاد ایرانی زل و44 راس از نژاد ایرانی لری بختیاری تهیه شد و پس از استخراج DNA ، نمونه ها با استفاده از آرایه های Ovine 50k SNP Chip تعیین ژنوتیپ شدند. داده های حاصل به منظور بررسی کیفیآنالیز شدند. پس از این مراحل، در نهایت مجموع 45154 نشانگر SNP مربوط به 31 حیوان آنالیزشدند . نمونه پشم این حیوانات نیز جمع آوری و صفات میانگین قطر الیاف و نسبت الیاف مساوییا بیشتر از 31 میکرومتر، با استفاده از فناوری OFDA اندازه گیری شدند. در آنالیزهای آماری اثر عوامل ثابت گله، سال تولد و جنس حیوان بررسی شد. پس از شناسایی تاثیرات معنا دار، آزمونپویش ژنومی در نرم افزار PLINK ارزیابی و برای کنترل نرخ اشتباه از تصحیح FDR استفاده شد.با در نظر گرفتن این نتایج در آنالیزهای پویش ژنومی، در مجموع سه جایگاه نشانگری روی کروموزوم های 1 و 4 با یک اثر معنا داری روی صفت نسبت الیافی که مساوی یا بیشتر از 31 میکرومتر هستند، شناسایی شد ) 15 p< (. بررسی ژن های شناسایی شده در این مناطق نیز نشان دهنده وجود ژن های مهم تاثیرگذار بر کیفیت پشم در این مناطق است

Keywords:

پویش ژنومی , جایگاه های صفات کمی , قطر پشم , گوسفند ایرانی