یک مرور کلی بر ابزارهای ایمونوانفورماتیک برای پیش بینی اپی توپ: اپی توپ های سلول های B و T

امروزه با گسترش بیماری های موجود و بروز بیماری های جدید، توجه ویژه به واکسیناسیون ضرورت می یابد. در ده ی گذشته با پیشرفت های صورت گرفته در فرایند توالی یابی ژن ها، توالی یابی پاتوژن ها با سرعت بیشتری انجام می گیرد. که خود فرآیند ساختن واکسن جدید را تسریع می کند. برای مبارزه با پاتوژن های مهاجم و سلول های آلوده به ویروس آگاهی از عملکرد سیستم ایمنی (ایمنی هومورال و ایمنی سلولی) از اهمیت بسیاری برخوردار است. آگاهی از این مراحل، در فرآیند پیش بینی اپی توپ ها و طراحی واکسن ضروری می باشد. با توجه به با پیشرفت های صورت گرفته در این زمینه، همچنان آزمایش های مورد نیاز برای شناسایی نواحی مناسب، پر هزینه می باشد و نیاز به ابزارهای ارزان،کاربردی، سریع و با دقت بالا ضروری می باشد. ایمونوانفورماتیک با توجه به این نیاز شکل گرفت. این علم، شاخه ای از بیوانفورماتیک می باشد که با رشد سریع بیوانفورماتیک و داده های عظیم حاصل از توالی یابی ژن ها، ایمونولوژی و واکسینولوژی شکل گرفت. امروزه پایگاه های بسیاری همچون ,SYFPEITHI ,BIMAS ,ProPred NetCTL برای سلول های T و ,BepiPred ABCPredو Bcepredبرای سلول های B ایجاد شده است. این مقاله ابزارهای موجود برای پیش بینی اپی توپ های B و T مناسب، جهت طراحی واکسن را مورد بحث و بررسی قرار داده است.

Keywords:

پیش بینی اپی توپ , طراحی واکسن , ایمونوانفورماتیک , بیوانفورماتیک , سلول B , سلول T