آنالیز تصاویر الکتروفورز ژل دو بعدی از نمونه های بیولوژیکی
Publish place: 16th Iranian conference on Biomedical Engineering
Publish Year: 1388
Type: Conference paper
Language: Persian
View: 6,650
This Paper With 7 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
Export:
Document National Code:
ICBME16_036
Index date: 2 July 2009
آنالیز تصاویر الکتروفورز ژل دو بعدی از نمونه های بیولوژیکی abstract
الکتروفورز ژل دو بعدی موثرترین روش در تفکیک پروتئینها در نمونه های بیولوژیکی است که اساس علم پروتئوم را تشکیل می دهد. در این روش بعد از جداسازی پروتئینها در دو بعد، تصویر ژل آنها تهیه می شود. با مقایسه تصاویر ژل در دو نمونه سالم و نمونه بیمار یا تحت درمان می توان نشانگرهای حیاتی را در این نمونه ها یافت. این نشانگرها آشکار کننده تغییرات در بیان پروتئینی درنمونه های بیولوژیکی می باشند. تحلیل این تصاویر مستلزم سه مرحله ناحیه بندی، تطابق و آنالیز آماری می باشد. در این مقاله درمرحله ناحیه بندی ابتدا تصاویر با فیلتر لاپلاسین گوسین لبه یابی می شود. و سپس از الگوریتم حوضچه آبگیر با نشانگرهای کنترل شده برای ناحیه بندی استفاده می گردد. برای اصلاح ناحیه بندی و تفکیک نواحی مناسب از آرتیفکت ها ویژگیهای شکل از نواحی استخراج می گردند. در مرحله تطابق بایست نواحیی که در دو تصویر با هم مطابقت دارند مشخص گردند. جهت این امر نواحیی که مرکز آنها در فاصله اقلیدوسی مناسب از هم در دو شکل قرار گرفته اند به لحاظ ویژگیهای گوناگون با هم مقایسه می گردند و ماتریسهای اختلاف این ویژگیها در دو ناحیه محاسبه می شوند. دو ناحیه ای که در دو تصویر کمترین اختلاف ویژگیها را دارند به عنوان نواحی تطابق یافته انتخاب می شوند. در مرحله آنالیز آماری باید نواحی تطابق یافته در دو تصویر به لحاظ ویژگیهای آماری مقایسه گردند تا نواحیی که حذف یا اضافه شده اند و یا از لحاظ ساختار و فراوانی دچار تغییرات معنادار شده اند به عنوان نشانگرهای حیاتی آشکار گردند. جهت آنالیز آماری در این مقاله از تستهای تی و ویلکاکسون استفاده می گردد. تصاویری که در این مقاله بررسی می شوند تصاویری از ژلهای تهیه شده از رده سلولی BHK در دو نمونه سالم و نمونه آلوده به ویروس هاری می باشند.
آنالیز تصاویر الکتروفورز ژل دو بعدی از نمونه های بیولوژیکی Keywords:
آنالیز تصاویر الکتروفورز ژل دو بعدی از نمونه های بیولوژیکی authors
پگاه شرف صالح
دانشگاه تربیت مدرس
محمدحسین میران بیگی
دانشگاه تربیت مدرس
بهروز وزیری
انستیتو پاستور ایران
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :