آنالیز پروفایل بیان ژن به منظور معرفی بیومارکرها جهت تشخیص مصرف غیر قانونی محرک های رشد در کشتارگاه ها

باتوجه به اینکه بررسی وجود باقی مانده هورمون های محرک رشد در لاشه حیوانات کشتار شده در کشتار گاه به عنوان یک خطر بالقوه برای سلامت افراد جامعه ضروری می باشد. در این پژوهش با آنالیز داده های بدست آمده از تکنیک میکرو اری 10 ماهیچه پا گاو گوشتی نر، شامل گروهی که هورمون محرک رشد دگزامتازون دریافت کرده اند و گروهی که هیچ محرک رشدی دریافت نکرده اند به بررسی ژن هایی با بیان افتراقی، به منظور شناسایی بیومارکرها تشخیصی جهت استفاده غیر قانونی محرک های رشد پرداخته شد. برای رسیدن به این هدف، کنترل کیفیت پروفایل ژنی حاصل از تکنیک میکرواری با شماره دسترسیGSE12179 با استفاده از بسته نرم افزاری Limma در نرم افزار R مورد آزمون قرار گرفت. تعیین میزان بیان هر ژن و بررسی ژنهای متفاوت بیان شده با استفاده ازبسته های نرم افزاری Biobase و GEOquery انجام شد. آنالیز مسیرهای ژنی بر اساس ژن هایی که تفاوت بیان داشتند، با استفاده از نرم افزار اینترنتی PANTER صورت گرفت. آنالیز مسیرهای ژنی نشان داد، مسیرهای فاکتور رشد بتا،گیرنده فاکتور رشد و آزادسازی هورمون گنادوتروپین معنی دار می باشند. جهت شناسایی بیومارکرهای موثر می توان از ژن ها، فاکتورهای رونویسی و کوفاکتورهای دخیل در این مسیرهای ژنی کمک گرفت زیرا این مسیرها به طور مستقیم بر فرآیند رشد و تکثیر سلول ها موثر هستند.

Keywords:

بیومارکر کاندیدا , تشخیص تقلبات , مسیر بیولوژی , میکرواری