تنوع نوکلئوتیدی ژن های مقاومت به زنگ قهوه ای در ژنوتیپ های مقاوم و حساس گندم نان
Publish place: Journal of agricultural biotechnology، Vol: 10، Issue: 2
Publish Year: 1397
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 539
This Paper With 24 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
Export:
Document National Code:
JR_JOAGK-10-2_010
Index date: 10 June 2019
تنوع نوکلئوتیدی ژن های مقاومت به زنگ قهوه ای در ژنوتیپ های مقاوم و حساس گندم نان abstract
زنگ قهوهای (Leaf rust) یکی از بیماریهای مهم گندم در سطح جهان است که اپیدمی آن منجر به کاهش عملکرد و کیفیت گندم نان میشود. در این مطالعه، تغییرات ساختاری و تنوع نوکلئوتیدی ژنهای مقاومت به زنگ قهوهایLr1، Lr21، Lr51 وLr39 در هفت ژنوتیپ گندم نان با واکنش متفاوت به زنگ قهوهای بررسی گردید. ژنهای مقاومت به زنگ قهوهای و یا نواحی پیوسته با این ژنها با استفاده از آغازگرهای اختصاصی طراحی شده بر اساس توالیهای موجود در بانکهای اطلاعاتی تکثیر شدند. قطعات تکثیری در باکتری E. coli همسانهسازی و توالییابی گردیدند. همردیف کردن توالی ژنهای مورد مطالعه با توالیهای موجود در بانک اطلاعاتی NCBI، شباهت بالای آنها را با توالی ژنهای مقاومت از جمله ژنهای خانواده NBS-LR و RGAها نشان داد. همردیفی قطعات تکثیر شده از ژنهای مورد مطالعه با توالیهای موجود در NCBI نشان دهنده شباهت قطعه تکثیر شده از ژن Lr51، با ژن agp2 بود. توالی ژن Lr39 با ژن VRN1، مسئول بهارهسازی در گندم زمستانه، 88 شباهت درصد داشت. نتایج بدست آمده از همردیف کردن توالیها و گروهبندی آنها، حاکی از وجود تغییرات ساختاری و تنوع نوکلئوتیدی این ژنها در ارقام مورد مطالعه بود. نسبت جایگزینیهای همنام به ناهمنام Ka/Ks)) در قطعات تکثیر شده از ژن Lr1 با استفاده از جفت آغازگرهای Lr1-2، Lr1-3 وLr1-4 و ژنهای Lr21 وLr39 کوچکتر از یک و نشان دهنده گزینش منفی برای جایگزینی یک اسیدآمینه در این ناحیه از این ژنها بود. در قطعه ژن تکثیر شده از ژن Lr1 با استفاده از جفت آغازگر Lr1-5 نسبت Ka/Ks بیشتر از یک و نشان دهنده گزینش مثبت یا گزینش در جهت ایجاد تنوع برای جایگزینی یک اسیدآمینه است. از نظر توالی ژنهای Lr1، Lr21، Lr39 وLr51، ژنوتیپهای مورد مطالعه فقط از نظر چند نوکلئوتید تفاوت داشتند که براساس این تفاوتهای نوکلئوتیدی میتوان آغازگرهای اختصاصی مبتنی بر SNPها جهت شناسایی ژنوتیپهای حساس و مقاوم طراحی کرد.
تنوع نوکلئوتیدی ژن های مقاومت به زنگ قهوه ای در ژنوتیپ های مقاوم و حساس گندم نان Keywords:
تنوع نوکلئوتیدی ژن های مقاومت به زنگ قهوه ای در ژنوتیپ های مقاوم و حساس گندم نان authors
رحیمه همتی گوگه
فارغ التحصیل کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی، گروه به نژادی و بیوتکنولوژی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران
ابوالقاسم محمدی
استاد، گروه به نژادی و بیوتکنولوژی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران
سعید اهری زاده
قطب علمی اصلاح مولکولی غلات، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :