شناسایی جایگاه های رتروترنسپوزونی (IRAP) مرتبط با مقاومت به بیماری پوسیدگی اسکلروتینیایی ساقه (.Sclerotinia spp) در آفتابگردان

رقیه نجف زاده; رضا درویش زاده; خدیجه موسی خلیفانی; مسعود ابرین بنا

شناسایی جایگاه های رتروترنسپوزونی (IRAP) مرتبط با مقاومت به بیماری پوسیدگی اسکلروتینیایی ساقه (.Sclerotinia spp) در آفتابگردان

Publish place: Journal of agricultural biotechnology، Vol: 8، Issue: 3

Publish Year: 1395

Type: Journal paper

Language: Persian

This Paper With 22 Page And PDF Format Ready To Download

DOWNLOAD Paper

Certificate
I'm the author of the paper

این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

کشاورزی > آفتابگردان

Export:

Link to this Paper:

https://civilica.com/doc/864909

Document National Code:

JR_JOAGK-8-3_007

Index date: 10 June 2019

شناسایی جایگاه های رتروترنسپوزونی (IRAP) مرتبط با مقاومت به بیماری پوسیدگی اسکلروتینیایی ساقه (.Sclerotinia spp) در آفتابگردان abstract

بیماری اسکلروتینیا از بیماریهای قارچی مهم آفتابگردان در ایران میباشد که باعث کاهش رشد و عملکرد محصول میشود. در پژوهش حاضر واکنش 100 لاین آفتابگردان روغنی به 6 جدایه قارچ اسکلروتینیا مورد بررسی قرار گرفت و سپس به منظور شناسایی مکانهای ژنی دخیل در مقاومت به بیماری از 128 جایگاه ژنومی تکثیر شده توسط آغازگرهای رتروترنسپوزونی IRAP استفاده شد. نتایج نشان داد که تنوع بالایی در ژرمپلاسم مورد مطالعه برای مقاومت به بیماری پوسیدگی اسکلروتینیایی ساقه وجود دارد. بررسی ساختار جمعیت، لاینهای مورد مطالعه را به 3 زیرجمعیت احتمالی (3=K) تقسیم نمود. در تجزیه ارتباط با دو مدل GLM و MLM به ترتیب 14 و 11 مکان ژنومی پیوسته با مقاومت به بیماری (P≤0.01) شناسایی شد. نشانگرهایLTR 1063-65 ،LTR 1064-65 وLTR 1062 با ژنهای کنترل کننده مقاومت به چندین جدایه قارچ عامل بیماری پیوسته بودند. نشانگرهای مشترک به دلیل تسهیل گزینش همزمان برای ایجاد مقاومت به چندین جدایه قارچی، میتوانند در برنامههای بهنژادی آفتابگردان نظیر انتخاب به کمک نشانگر (MAS) بخوبی استفاده شوند.

شناسایی جایگاه های رتروترنسپوزونی (IRAP) مرتبط با مقاومت به بیماری پوسیدگی اسکلروتینیایی ساقه (.Sclerotinia spp) در آفتابگردان Keywords:

آفتابگردان , بیماری قارچی , نشانگر IRAP , تجزیه ارتباط

شناسایی جایگاه های رتروترنسپوزونی (IRAP) مرتبط با مقاومت به بیماری پوسیدگی اسکلروتینیایی ساقه (.Sclerotinia spp) در آفتابگردان authors

رقیه نجف زاده

گروه اصلاح و بیوتکنولوژی گیاهی، دانشگاه ارومیه، ارومیه و بنیاد ملی نخبگان، تهران و استادیار، گروه گیاهان دارویی، مرکز آموزش عالی شهید باکری، دانشگاه ارومیه، میاندوآب.

رضا درویش زاده

استاد، گروه اصلاح و بیوتکنولوژی گیاهی، دانشگاه ارومیه، ارومیه و استاد، پژوهشکده زیست فناوری دانشگاه ارومیه، ارومیه

خدیجه موسی خلیفانی

دانش آموخته کارشناسی ارشد، گروه اصلاح و بیوتکنولوژی گیاهی، دانشگاه ارومیه، ارومیه

مسعود ابرین بنا

استادیار، گروه گیاهپزشکی، دانشگاه ارومیه، ارومیه

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :

Amoozadeh M, Darvishzadeh R, Davar R, Abdollahi-Mandoulakani B, Haddadi P, ...

Andersen JR, Zein I, Wenzel G, Krützfeldt B, EderJ, Ouzunova ...

Anonymous (2010). Agribusiness handbook: sunflower crude and refined oil. FAO/EBRD. ...

Bardin SD, Huang HC (2001). Research on biology and control ...

inCanada. Canadian Journal of Plant Pathology 23: 88–98. ...

Basirnia A, Darvishzadeh R, Abdollahi Mandoulakani B (2016). Retrotransposon insertional ...

Basirnia A, Darvishzadeh R, Abdollahi Mandoulakani B, Nabipur A (2014). ...

: 19-33 (In Persian). ...

Bert P, Jouan F, Tourvieille de Labrouhe D, Seere F, ...

Bert PF, Dechamp-Guillaume G, Serre F, Jouan I, Tourvieille de ...

Sclerotinia sclerotiorum and Phoma macdonaldi. Theoretical and Applied Genetics 109: ...

Boland GJ, Hall R (1994). Index of plant hosts of ...

BoltonMD, Thomma BP, Nelson BD (2006). Sclerotinia sclerotiorum (Lib.) de ...

Breseghello F, Sorrells ME (2006). Association mapping of kernel size ...

in wheat (Triticum aestivum L.) cultivars. Genetics 172: 1165-1177. ...

Cardon LR, Palmer LJ (2003). Population stratification and spurious allelic ...

Castaño F, Vear F, Tourvieille de Labrouhe D (1993). Resistance ...

Collard BCY, Jahufer MZZ, Brouwer JB, Pang ECK (2005). An ...

DadrasAR(2012). Evaluation of genetic diversity of tobacco (Nicotiana tabacum L.) ...

Darvishzadeh R (2012). Association of SSR markers with partial resistance ...

Davar R, Darvishzadeh R, Majd A (2011). Genotype-isolate interaction for ...

Davar R, Darvishzadeh R, Majd A, Ghosta Y, Sarrafi A ...

Dewan A, Liu M, Hartman S, Zhang SSM, Liu DT, ...

Emamgholi A, Zaefizadeh M, Imani A (2015). The proteomic analysis ...

Ershad J (1995). Fungi of Iran. Agricultural Research, Education and Extension Organization ...

Evanno G, Regnaut S, Goudet J (2005). Detecting the number ...

Falush D, Stephens M, Pritchard JK (2003). Inference of population ...

Fusari CM, Di-Rienzo JA, Troglia C, Nishinakamasu V, Moreno MV, ...

Doi: 10.1186/1471-2229-12-93. ...

Gentzbittel L, Mouzeyar S, Badaoui S, Mestries E, Vear F, ...

Ghavami F, Elias EE, Mamidi O, Ansari M, Sargolzaei T, ...

Gulya TJ K, Rashid Y, Masirevic SN (1997). Sunflower diseases, ...

Hahn V (2002). Genetic variation for resistance to Sclerotinia head ...

Hall D, Tegström C, Ingvarsson PK(2010). Using association mapping to ...

Hatami Maleki H, Darvishzadeh R, Mohseni Z (2014). Evaluation of ...

Hittalmani S, Huang N, Courtois B, Venuprasad R, Shashidhar HE, ...

Jannatdoust M, Darvishzadeh R, Ziaeifard R, Azizi H, Gholinezhad E ...

Jun TH, Van K, Kim MY, Lee SH,Walker DR(2008). Association ...

Lander ES, Botstein D (1989). Mapping Mendelian factors underlying quantitative ...

Liu L, Wang L, YaoJ, Zheng Y, Zhao C (2010). ...

Mestries E, Gentzbittel L, Tourvieille de Labrouhe D, Nicolas P, ...

Micic Z, Hahn V, Bauer E, Scho¨n CC, Knapp J, ...

Micic Z, Hahn V, Bauer E, Schon CC, Melchinger AE ...

Micic Z, Hahn V, Bauer E, Melchinger AE, Knapp SJ, ...

Mohan M, Nair S, Bhagwat A,KrishnaTG, Yano M, Bhatia CR, ...

Price K, Colhoun J (1975). A study of variability of ...

Pritchard JK, Stephens MN, RosenbergN, Donnelly P (2000). Association mapping ...

Pritchard JK, Donnelly P (2001). Case control studies of association ...

Rafalski A (2002a). Applications of single nucleotide polymorphisms in crop ...

Current Opinion in Plant Biology 5: 94. ...

Rafalski JA (2002b). Novel genetic mapping tools in plants: SNPs ...

Rojas EV (2014). Physiological, anatomical and molecular characterization of partial ...

Rönicke S, Hahn V, Vogler A, Friedt W (2005). Quantitative ...

Rostok N, Ramsay L, MacKenzie K, Cardle L, Bhat PR ...

Saeed M, Wangzhen G, Tianzhen Z (2014). Association mapping for ...

Saharan GS, Mehta N (2008). Economic importance. Sclerotinia Diseases of Crop ...

Sahranavard-Azartamar F, Darvishzadeh R, Ghadimzadeh M, Azizi H, Aboulghasemi Z ...

in different oily sunflower (Helianthus annuus L.) lines using association ...

Sharma R, Meena PD, Verma PR, Saharan GS, Naresh M, ...

A review. Journal of Oilseed Brassica 6: 1-44. ...

Talukder ZI, Hulke BS, Qi L, Scheffler BE, Pegadaraju V, ...

Tang S, Yu JK, Slabaugh MB, Shintani DK, Knapp SJ ...

Tuberosa R, Salvi S, Sanguineti MC, Landi P, Maccaferri M, ...

Yu JM, Buckler ES (2006). Genetic association mapping and genome ...

Yu J, Pressoir G, Briggs WH, Vroh Bi I, Yamasaki ...

Nature Genetics 38: 203-208. ...

Yue B, Radi SA, Vick BA, Cai X, Tang S, ...

Vollmann J, Rajcan I (2010). Oil Crop Breeding & Genetics, ...

Wang M, Jiang N, Jia T, Leach L, Cockram J, ...

Zhang Q, Wu C, FY, Ren FY, and Zhang C ...

Zhu C, Gore M, Buckler ES, Yu J (2008). Status ...

in plants. Plant Genome 1: 5-20. ...

نمایش کامل مراجع