سیویلیکا را در شبکه های اجتماعی دنبال نمایید.

Login
PapersConferencesJournals

ارزیابی مقایسه ای نشانگرهای CBDP و SCoTدر بررسی تنوع ژنتیکی موجود در توده های مختلف Aegilops

Publish place: Journal of agricultural biotechnology، Vol: 11، Issue: 4
Publish Year: 1398
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 527

This Paper With 22 Page And PDF Format Ready To Download

DOWNLOAD Paper

Export:

Link to this Paper:
https://civilica.com/doc/1006699

Document National Code:

JR_JOAGK-11-4_009

Index date: 6 April 2020

ارزیابی مقایسه ای نشانگرهای CBDP و SCoTدر بررسی تنوع ژنتیکی موجود در توده های مختلف Aegilops abstract

هدف: اهداف اصلی این مطالعه ارزیابی تنوع ژنتیکی موجود در 103 توده Aegilops و مقایسه کارایی دو نشانگر مولکولی SCoT (Start codon targeted) و CBDP (CAAT box-derived polymorphism) بود. مواد و روش­ها: در این مطالعه تنوع ژنتیکی 103 توده وحشی متعلق به هفت گونه Aegilops شامل هفت نمونه از Ae. caudata، 14 نمونه از Ae. crassa، 19 نمونه از Ae. cylindrica، 11 نمونه از Ae. neglecta، 20 نمونه از گونه Ae. tauschii، 15 نمونه از Ae. triuncialisو 17 نمونه از Ae. umbellulata استفاده شد با استفاده از 30 آغازگر SCoT و CBDP مورد ارزیابی قرار گرفتند. نتایج: در مجموع 15 آغازگر SCoT و 15  آغازگر CBDP به ترتیب 164 و 141 قطعه چند شکل تکثیر کردند. متوسط کلیه شاخص­های تعیین کننده کارایی نشانگرهای مولکولی برای آغازگرهای SCoT بیشتر از CBDP بود. هر دو سیستم نشانگری از مقدار PIC یکسانی برخوردار بودند. نتایج تجزیه واریانس مولکولی (AMOVA) نشان داد بیشترین سهم واریانس ژنتیکی مربوط به درون گونه­ها می­باشد. مقایسه پارامترهای ژنتیکی درون جمعیتی نشان داد که در بین گونه­های مورد ارزیابی، Ae. cylindricaنسبت به سایر گونه­ها از تنوع بیشتری برخوردار بود. تجزیه خوشه­ای بر اساس هر یک از سیستم­های نشانگری کلیه توده­های مورد بررسی را به دو گروه اصلی تفکیک نمود. الگوی گروه­بندی به وجود آمده بر اساس آغازگرهای CBDP روند فیلوژنتیکی مشخصی را بین برخی از گونه­های Aegilops نشان داد، به­طوریکه نتایج تجزیه به مختصات اصلی (Principal Coordinates Analysis) گروه­بندی به دست آمده را تایید نمود. نتیجه­گیری: هر دو سیستم نشانگری به خوبی قادر به شناسایی چندشکلی موجود در نمونه­های مورد بررسی بودند، با این حال داده های CBDP الگوی گروه­بندی دقیق­تری را بر اساس روابط فیلوژنتیکی نشان داد. از اینرو استفاده از این نشانگرها به صورت مجزا و یا در ترکیب با سایر نشانگرها در بررسی روابط فیلوژنتیکی توصیه می­شود.

ارزیابی مقایسه ای نشانگرهای CBDP و SCoTدر بررسی تنوع ژنتیکی موجود در توده های مختلف Aegilops Keywords:

ارزیابی مقایسه ای نشانگرهای CBDP و SCoTدر بررسی تنوع ژنتیکی موجود در توده های مختلف Aegilops authors

علیرضا پورابوقداره

موسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران

علیرضا اطمینان

کرمانشاه دانشگاه آزاد اسلامی واحد کرمانشاه

لیا شوشتری

گروه اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، واحد کرمانشاه، دانشگاه آزاد اسلامی، کرمانشاه، ایران

ندا ملکی تبریزی

دانشکده علوم و مهندسی کشاورزی دانشگاه تهران، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشگاه تهران، ایران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
Ahmadi J, Pour-Aboughadareh A, Fabriki-Ourang S et al. (2018a) Screening ...
Ahmadi J, Pour-Aboughadareh A, Ourang SF et al. (2018b) Wild ...
Altintas S, Toklu F, Kafkas S et al. (2008) Estimating ...
Anderson JA, Churchill GA, Autrique JE et al. (1993) Optimizing ...
Badaeva E, Amosova A, Samatadze T et al. (2004) Genome ...
Badfar-Chaleshtori S, Shiran B, Kohgard M et al. (2012) Assessment ...
Collard BCY, Mackill DJ (2009) Start codon targeted (SCoT) polymorphism: ...
Doyle JJ, Doyle KJ (1987) A rapid DNA isolation procedure ...
Etminan A, Mehrabi AA, Shooshtari L, Moradkhani H (2018a) Applicability ...
Etminan A, Pour-Aboughadareh A, Mohammadi R et al. (2016) Applicability ...
Etminan A, Pour-Aboughadareh A, Mohammadi R et al. (2018b) Applicability ...
Etminan A, Pour-Aboughadareh A, Noori A et al. (2018c) Genetic ...
Feldman M, Sears ER (1981) The wild gene resources of ...
Hajjar R, Hodgking T (2007) The use of wild relatives ...
Hamidi H, Talebi R, Keshavarz F (2014) Comparative efficiency of ...
Heidari P, Etminan A, Azizinezhad R, Khosroshahli M (2017) Genomic ...
Kharestani H, Nasrolah Nejad Qomi AA, Mehrabi AA (2013) Genetic ...
Kilian B, Ozkan H, Deusch O et al. (2007) Independent ...
Kumar M, Mishra GP, Singh R et al. (2009) Correspondence ...
Maxted N, Kell S (2009) CWR in crop improvement: To ...
Mohammadi SA, Prasanna BM (2003) Analysis of genetic diversity in ...
Moradkhani H, Mehrabi AA, Etminan A, Pour-Aboughadareh A (2015) Molecular ...
Moradkhani H, Pour-Aboughadareh AR, Mehrabi AA, Etminan A (2012) Evaluation ...
Mousavifard SS, Saeidi H, Rahiminejad MR, Shamsadini M (2015) Molecular ...
Naghavi MR, Hajikram M, Taleei AR, Aghaei MJ (2010) Microsatellite ...
Naghavi MR, Maleki M, Alizadeh H et al. (2009) An ...
Nevo E (1998) Genetic diversity in wild cereals: regional and ...
Peakall R, Smouse PE (2006) GENALEX 6: genetic analysis in ...
Peng X, JiQ, Fan S et al. (2015) Genetic diversity in populations ...
Poczai P, Varga I, Laos M et al. (2013) Advances in plant gene-targeted and functional markers: a ...
Pour-Aboughadareh A, Ahmadi J, Mehrabi AA et al. (2017a) Physiological ...
Pour-Aboughadareh A, Ahmadi J, Mehrabi AA et al. (2018b) Insight ...
Powell W, Morgante M, Andre C et al. (1996) The ...
Prevost A, Wilkinson MJ (1999) A new system of comparing ...
Qaderi A, Omidi M, Pour-Aboughadareh A et al. (2019) Molecular ...
Saidi A, Jabalameli Z, Ghalamboran M (2018) Evaluation of genetic diversity of ...
Schneider A, Molnar I, Molnar-Lang M (2008) Utilisation of Aegilops ...
Singh AK, Rana MK, Singh S et al. (2014) CAAT ...
Tamura K, Peterson D, Peterson N et al. (2011) MEGA5: ...
Tiwari G, Singg R, Singh N et al. (2016) Study ...
Warschefsky E, Penmetsa RV, Cook DR, von Wettberg EJB (2014) ...
Weide A, Rieh S, Zeidi M, Conard NJ (2013) Using ...
نمایش کامل مراجع