مطالعه داکینگ مولکولی تاوروکولیک اسید و مشتق آن بر کپسیدHTLV-1

ویروس HIV-1 و HTLV-1 هر دو متعلق به خانواده رتروویریده هستند. از شایع ترین بیماری های مرتبط با عفونت HTLV-1 می توان به میلوپاتی/ فلج اسپاسمی مناطق گرمسیری یا HAM/HSP ، سرطان خون مرتبط با سلول T بزرگسالان (ATL)، اختلال های عنبیه و درماتیت عفونی در انسان اشاره کرد و همچنین ویروس HIV-1 باعث ابتلا به ایدز یا سندروم نقص ایمنی اکتسابی می گردد. ساختار کپسید درهمانندسازی و بلوغ ویروس نقش بسزایی دارد. تاوروکولیک اسید و گلیکوداکسی کولات در طی آزمایشات تجربی به عنوان مهارکننده های قوی کپسید HIV-1 شناخته شده اند. در تحقیق حاضر باتوجه به هم خانواده بودن دو ویروس HIV-1 وHTLV-1 و شباهت بین کپسید هر دو ویروس، اثر ترکیبات مهاری تاوروکولیک اسید و مشتق آن با استفاده از داکینگ مولکولی بر روی ساختار پروتئینی کپسید HTLV-1 مورد ارزیابی قرار گرفته است. روش ها: تطبیق ساختار پروتئینی کپسید هر دو ویروس در سرور وب انجام پذیرفت که نشان دهنده تشابه بیش از %34 بود. هر دو ترکیب مهاری تاوروکولیک اسید و گلیکوداکسی کولات که اثرات مهاری آن ها بر کپسید HIV-1 تائید شده بود طراحی شد. کپسید ویروسHTLV-1 از پایگاه داده پروتئینی استخراج شد و ساختارکپسید تحت شبیه سازی دینامیک مولکولی قرار گرفت و داکینگ مولکولی انجام پذیرفت. نتایج بدست آمده از داکینگ مولکولی نشان دهنده اثرات بالقوه ترکیبات مهاری و میانکنش های موثر با دمین های کپسید HTLV-1 است که در نتیجه این ترکیب می توانند به عنوان مهارکننده موثر بلوغ و تکثیر ویروسHTLV-1 مطرح شود.

Keywords:

HTLV-1 , کپسید , طراحی دارو , داکینگ مولکولی , دینامیک مولکولی