مطالعه بیوانفورماتیکی داروهای ضد ویروسی بر گلیکوپروتئین سطحی اسپایک(S) درکرونا ویروس با استفاده از نرم افزار Autodock Vina

شیوع اخیر کرونا ویروس سندروم حاد2)2-SARS-Cov( عامل ایجاد کننده بیماری کورونا ویروس19(19covid) در دسامبر2019، نگرانیهای جهانی بهداشت را برانگیخته است .2-SARS-CoV یک RNA ویروس تک رشته ای با سو مثبت است. دوره نهفتگی از 2 تا 14 روز متغیر است و بعد از این مدت علائم و نشانه های بیماری ظاهر میشود. علائم و نشانههای رایج میتواند شامل تب، سرفه، خستگی و علائم دیگر شامل: تنگی نفس یا مشکل در تنفس، درد عضلانی، لرز، گلودرد، از بین رفتن طعم یا بو، احساس سردرد و درد قفسه سینه میباشد. 2-SARS-Cov از طریق گیرنده آنزیم مبدل آنژیوتانسین نوع2 به سلولهای ریه حمله میکند و باعث درگیرشدن این سلولها میشود. مطالعات نشان دادهاند که گلیکوپروتئین اسپایک(S) نقش مهمی در اتصال به گیرنده آنزیم مبدل آنژیوتانسین نوع2 برای ورود به سلول دارند. داروهای ضد ویروسی مانند Remikiren ،Nelfinavir ،Chloroquine ،Remdesvir و Ledipasvir برای کاهش علائم 19-COVID استفاده میشوند. در این مطالعه، انرژی اتصال داروها به حوزه محل اتصال گیرنده در گلیکوپروتئین اسپایک(S) توسط مطالعات silico بررسی شده است. ساختار سه بعدی داروها از سرور بانک دارویی و قالب پی دی بی گیرنده (VYB6) از بانک دادههای پروتئینی )PDB( دریافت شد. سپس، گیرنده و داروها متصل شدند و انرژی اتصال و بازده اتصال با استفاده از نرم افزار Autodock Vina ارزیابی شد. نتایج نشان داد کهNelfinavir دارای اتصال پایدارتری با گیرنده است زیرا انرژی اتصال کمتری نسبت به سایر داروهای ذکر شده دارد. از ترکیبات Nelfinavir ممکن است برای تولید داروهای ضد ویروسی جدید علیه 19COVID استفاده شود.

Keywords:

کرونا ویروس , Nelfinavir , Autodock Vina , گلیکوپروتئین اسپایک (S)