شناسایی ژنها، مسیرهای زیستی و سیگنالینگ موثر در تنش گرمایی با استفاده از دادههای ریزآرایه در ‏طیور

  تنش گرمایی در طیور تاثیر بهسزایی در کاهش عملکرد، سیستم ایمنی و افزایش تلفات دارد. با توجه به تعاملات میان مسیرهای زیستی دخیل در تنش گرمایی و اهمیت تنظیمکنندگی آنها، استفاده از یک رویکرد جامع برای مطالعه تنش گرمایی ضروری میباشد. در این مطالعه اثرات تنش گرمایی بر بیان ژن در دو گروه از جوجههای گوشتی تحت تاثیر تنش گرمایی و بدون تنش گرمایی (شاهد)، بررسی شد. در تجزیه، دادههای ریزآرایه تعداد ۱۰۰۰ ژن استخراج و پس از حذف ژنهای تکراری و خارج از سطح معنیداری در بیان (۰۱/۰P<)، تعداد ۷۰۹ ژن شناسایی شد. با بهرهگیری از سایت String و آنالیز ژنها در نرمافزار Cytoscape، تعداد ۱۱۵ ژن در چهار ماژول عملکردی شناسایی شد که در مسیرهای زیستی اسپلایسوزوم، یوبیکویتین واسطهگر پروتئولیز، بیوژنز ریبوزوم، پردازش پروتئین در شبکه آندوپلاسمی، اتوفاژی-حیوانی و مسیرهای سیگنالینگ سیستم ایمنی ذاتی، MAPK Pathway و پیری سلولی دخیل بودند. نتایج این پژوهش نشان میدهد که تنش گرمایی در طیور نقش مهمی در عملکرد رشد، سیستم ایمنی و سایر مکانیسمهای بیولوژیکی دارد. شناسایی ژنهای موثر در تنش گرمایی همچون PTEN و HSPها در پرندگان و بررسی دادههای ریزآرایه، میتواند افق جدیدی را در درک بهتر فرآیندهای زیستی مرتبط با تنش گرمایی پیش روی ما قرار دهد.

Keywords:

بیان ژن , تنش گرمایی , ریزآرایه , مسیر زیستی , مسیر سیگنالینگ