ردیابی و شناسایی برخی از گونه های جنس سودوموناس عامل پوسیدگی نرم با استفاده از ژن tuf

پریسا امامی; مهدی مهرابی کوشکی; جمشید حیاتی; میلاد آئینی

ردیابی و شناسایی برخی از گونه های جنس سودوموناس عامل پوسیدگی نرم با استفاده از ژن tuf

Publish place: Biological Journal of Microorganisms، Vol: 8، Issue: 32

Publish Year: 1398

Type: Journal paper

Language: Persian

This Paper With 14 Page And PDF Format Ready To Download

DOWNLOAD Paper

Certificate
I'm the author of the paper

این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

کشاورزی > ذرت

Export:

Link to this Paper:

https://civilica.com/doc/1198674

Document National Code:

JR_BJM-8-32_008

Index date: 8 May 2021

ردیابی و شناسایی برخی از گونه های جنس سودوموناس عامل پوسیدگی نرم با استفاده از ژن tuf abstract

مقدمه: بیماری پوسیدگی نرم در گیاهان که توسط عوامل باکتریایی بیماریزا ایجاد میشوند، هرساله سبب کاهش محصولات تولیدی و همچنین خسارت به محصولات انباری میگردند. تحقیق حاضر بهمنظور ردیابی و شناسایی عوامل باکتریایی عامل پوسیدگی نرم متعلق به جنس سودوموناس در برخی از محصولات صیفی و گیاهان تزیینی انجام شد. مواد و روشها: طی فصول زراعی در سالهای ۱۳۹۴ تا ۱۳۹۶، نمونههای مشکوک و دارای علائم بیماری از میزبانهای بادمجان، ذرت، برگ قاشقی، ذرت شیرین و گوجهفرنگی جمعآوری گردید. ویژگیهای بیوشیمایی و موفولوژیکی جدایهها بر اساس روشهای استاندارد باکتریشناسی بررسی شدند. همچنین ژن tuf در جدایههای نماینده با استفاده از آغازگرهای Bac-tuf-F و Bac-tuf-R به روش واکنش زنجیرهای پلی مراز تکثیر و پس از توالی یابی با بانک دادههای موجود در سایت NCBI با نرمافزار بلاست تجزیهوتحلیل و مقایسه شدند. نتایج: درمجموع ۱۲۰ جدایه باکتریایی از نمونههای موردنظر جداسازی گردید. بر اساس تولید آنزیم تجزیهکننده پکتین، پنج جدایه از جنس سودوموناس انتخاب شد. بر اساس نتایج آزمونهای بیوشیمیایی و همچنین فیلوژنی بر پایه توالی یابی ژن tuf، این جدایهها بهعنوان گونههای Pseudomonas aeruginosa، P. entomophila، P. mosselii و P. putida شناسایی شدند. بحث و نتیجهگیری: بر اساس دانش ما، این اولین گزارش از بیماریزایی P. aeruginosa در گوجهفرنگی، P. entomophila در ذرت شیرین و P. putida در بادمجان است. علاوه بر این، برای اولین بار P. aeruginosa و P. mosselii بهعنوان عامل همراه بیماری به ترتیب در ذرت و بادمجان گزارش میشود.

ردیابی و شناسایی برخی از گونه های جنس سودوموناس عامل پوسیدگی نرم با استفاده از ژن tuf Keywords:

بادمجان , ذرت , برگ قاشقی , ذرت شیرین , گوجه فرنگی

ردیابی و شناسایی برخی از گونه های جنس سودوموناس عامل پوسیدگی نرم با استفاده از ژن tuf authors

پریسا امامی

گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهوار، اهواز، ایران

مهدی مهرابی کوشکی

گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز، ایران

جمشید حیاتی

گروه آموزشی گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز، ایران

میلاد آئینی

گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز، ایران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :

(1) Wells JE., Butterfield JE., Revear LG. Identification of bacteria ...

(2) Farrar JJ., Nunez JJ., Davis RM. Influence of soil ...

(3) Agrios GN. Plant Pathology. 5th Ed. The Netherlands: Elsevier ...

(4) Lund BM. Bacterial spoilage. In: Demis C (Ed.). Postharvest ...

(5) Liao CB., Wells JM. Diversity of pectolytic, fluorescence Pseudomonas ...

(6) Pérombelon MCM. Potato diseases caused by soft rot erwinias: ...

(7) De Boer SH. Characterization of pectolytic erwinias as highly ...

(8) Yishay M., Burdman S., Valverde A., Luzzatto T., Ophir ...

(9) Bull CT., De Boer SH., Denny TP., Firrao G., ...

(10) Canaday CH., Wyatt JE., Mullins JA. Resistance in broccoli ...

(11) Euzéby JP. List of bacterial names with standing in ...

(12) Garrity GM., Bell JA., Lilburn TG., Class III. Gammaproteobacteria ...

(13) Krieg NR., Ludwig W., Whitman WB., Hedlund BP., Paster ...

(14) Dogan B., Boor K. Genetic diversity and spoilage potentials ...

(15) Moore ERB., Tindall BJ., Martins Dos Santos V., Pieper ...

(16) Höfte M., DeVos P. Plant pathogenic Pseudomonas species. In: ...

(17) Bull CT., De Boer SH., Denny TP., Firrao G., ...

(18) Bull CT., Coutinho TA., Denny TP., Firrao G., Fischer-Le ...

(19) Schaad NW., Jones JB., Chun W. Laboratory guide for ...

(20) Lelliott RA., Stead DE. Methods for the diagnosis bacterial ...

(21) Suslow T., Schroth M., Isaka M. Application of a ...

(22) Alexopoulou K., Oka A., Petinaki E., Jelastopulu E., Dimitracopoulos ...

(23) Emami P., Mehrabi-Koushki M., Hayati J., Aeini, M. Multi ...

(24) Hall TA. BioEdit: a user–friendly biological sequence alignment editor ...

(25) Tamura K., Stecher G., Peterson D., Filipski A., Kumar ...

(26) Das S., Dash HR., Mangwani N., Chakraborty J., Kumari ...

(27) Ludwig W., Weizenegger M., Betzl D., Leidel E., Lenz ...

(28) (28) Li X ., Xing J , Li B., Wang P. ...

(29) Starkey M., Rahme LG. Modeling Pseudomonas aeruginosa pathogenesis in ...

(30) Gao J., Wang Y., Wang CW., Lu BH. First ...

(31) Mondal KK., Mani C., Singh J., Dave SR., Tipre ...

(32) Cother EJ., Darbyshire B., Brewer J. Pseudomonas aeruginosa: cause ...

(33) Hao XJ., Xie GL. Internal brown rot of onion ...

(34) Rahme LG., Stevens EJ., Wolfort SF., Shao J., Tompkins ...

(35) Plotnikova JM., Rahme LG., Ausubel FM. Pathogenesis of the ...

(36) Yu L., Qin XY., Du J., Wang AY., Zhao ...

(37) Shanmugam V., Thakur H., Paul S., Bhadwal P., Mahajan ...

(38) Goumans DE., Chatzaki AK. Characterization and host range evaluation ...

(39) Liao CH., McCallus DE., Fett WF. Molecular characterization of ...

(40) Magro P., Varvaro L., Chilosi G., Avanzo C., Balestra ...

(41) Bauer DW., Collmer A. Molecular cloning, characterization, and mutagenesis ...

(42) Liao CH., Hung HY., Chatterjee AK. An extracellular pectate ...

(43) Charron CS., Samsm CE., Canaday CH. Impact of glucosinolate ...

(44) Yang HT., Ren ZX. Bacterial flower rot of Chinese ...

(45) Obradovic A., Mijatovic M., Ivanovic M., Arsenijevic M. Population ...

(46) Godfrey SAC., Marshall JW. Identification of cold-tolerant Pseudomonas viridiflava ...

(47) Vassilev VI. Pseudomonas marginalis pv. marginalis and some other ...

(48) Wright PJ., Cronin RD., Hale CN. A field and ...

(49) Kim YK., Lee SD., Choi CS., Lee SB., Lee ...

(50) Achbani EH., Sadik S., Kahkahi REl., Benbouazza A., Mazouz ...

(51) Elumalai PP., Mahadevan A. Characterization of pectate lyase produced ...

(52) Ibe SN., Grogan RG. Effect of controlled oxygen and ...

(53) Krejzar V, Mertelík J, Pánková I, Kloudová K, Kůdela ...

(54) Almeida IMG., Maciel KW., Neto JR., Beriam LOS. Pseudomonas ...

(55) Macagnan D., Romeiro RS., Macedo DM., Schurt DA. Podridão ...

(56) Goumas DE., Malathrakis NE., Chatzaki AK. Characterization of Pseudomonas ...

(57) Cottyn B., Heylen K., Heyrman J., Vanhouteghem K., Pauwelyn ...

(58) Aysan Y., Sahin S., Ulke G., Sahin F. Bacterial ...

(59) Dabboussi F., Hamze M., Singer E., Geoffroy V., Meyer ...

(60) McLellan E., Partridge D. Prosthetic valve endocarditis caused by ...

(61) Torre-Ruiz ND., Ruiz-Valdiviezo VM., Rincón-Molina CL., Rodríguez-Mendiola M., Arias-Castro ...

نمایش کامل مراجع