بررسی میزان بیان ژن های خانواده CBL، در تنش خشکی و حمله ویروس در دو رقم حساس و مقاوم به خشکی گوجه فرنگی با روش PCR نیمه کمی
Publish place: IRANIAN JOURNAL OF PLANT BIOLOGY، Vol: 9، Issue: 2
Publish Year: 1396
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 374
This Paper With 19 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_IJPB-9-2_006
تاریخ نمایه سازی: 26 اردیبهشت 1400
Abstract:
کلسیم، یک جزء حیاتی مهم برای شماری از مسیر های انتقال پیام در گیاهان است که به واسطه انواعی از گیرنده های اختصاصی از جمله پروتئین های شبه کلسی نورین B (CBL) در درک تنش های محیطی، عمل می کند. در پژوهش حاضر، با رویکردهای بیوانفورماتیک، ۱۱ ژن رمزکننده پروتئین های شبه کلسی نورین B با درجه حفاظت شدگی زیاد در گیاه گوجه فرنگی شناسایی و تایید شد. با بهره گیری از یک روش مبتنی بر ارتوژنی، این پروتئین ها به ۵ کلاس مجزای SlCBL۱، SlCBL۳، SlCBL۴، SlCBL۸ و SlCBL۱۰ تقسیم بندی و نام گذاری شدند. تحلیل توالی های پروتئینی نشان داد که همه اعضای CBLهای ۱ و ۴ که شامل ۵ پروتئین می شوند، یک ناحیه حفاظت شده مریستویلاسیون در بخش N-ترمینال دارند. بررسی با روش PCR نیمه کمی نشان داد که میان CBLهای کلاس ۱، بیان ژن SlCBL۱-۳ در هردو تنش خشکی، حمله ویروس و ترکیب این دو، تنها در رقم حساس افزایش داشته است. درباره CBLهای کلاس ۳، اگرچه دو ژن SlCBL۳-۱ و SlCBL۳-۲ در تنش خشکی در هردو رقم حساس و مقاوم، افزایش بیان نشان دادند، اعمال هم زمان دو تنش، اثر افزایشی بر بیان این ژن ها نداشت. بین دو همولوگ کلاس ۴ نیز، تنها SlCBL۴-۱ در هردو تنش خشکی و ویروس افزایش بیان نشان داد. براساس نتایج، رفتار بیانی ژن های کلاسSlCBL۸ در شرایط مختلف تنش و ارقام مختلف، متنوع بود. بیان تنها ژن موجود در کلاس SlCBL۱۰ نیز در رقم حساس با هیچ کدام از تنش های یاد شده افزایش نیافت و تنها در رقم مقاوم، در تنش خشکی افزایش بیان داشت. به طورکلی، استنباط شد که با تغییر الگوی بیان ژن های CBL در هردو تنش زیستی و غیرزیستی، احتمالا مسیر های پیام رسانی CBL/CIPK متفاوتی در گیاهان حساس و مقاوم فعال می شوند.
Keywords:
Authors
پیمان آقائی
گروه زیست شناسی، دانشگاه پیام نور، صندوق پستی ۳۶۹۷-۱۹۳۹۵ تهران، ایران
محمدعلی ابراهیمی
گروه بیوتکنولوژی، دانشگاه پیام نور، تهران، ایران
سید علی حسینی تفرشی
گروه سلولی و مولکولی، دانشکده شیمی، دانشگاه کاشان، صندوق پستی ۵۳۱۵۳-۸۷۳۱۷ کاشان، ایران
مریم حائری نسب
گروه زیست شناسی، دانشگاه پیام نور، صندوق پستی ۳۶۹۷-۱۹۳۹۵ تهران، ایران
شکوفه انتشاری
گروه زیست شناسی، دانشگاه پیام نور، صندوق پستی ۳۶۹۷-۱۹۳۹۵ تهران، ایران
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :