سیویلیکا را در شبکه های اجتماعی دنبال نمایید.

Login
PapersConferencesJournals

بررسی میزان بیان ژن های خانواده CBL، در تنش خشکی و حمله ویروس در دو رقم حساس و مقاوم به خشکی گوجه فرنگی با روش PCR نیمه کمی

Publish place: IRANIAN JOURNAL OF PLANT BIOLOGY، Vol: 9، Issue: 2
Publish Year: 1396
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 452

This Paper With 19 Page And PDF Format Ready To Download

DOWNLOAD Paper

این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

Export:

Link to this Paper:
https://civilica.com/doc/1213345

Document National Code:

JR_IJPB-9-2_006

Index date: 16 May 2021

بررسی میزان بیان ژن های خانواده CBL، در تنش خشکی و حمله ویروس در دو رقم حساس و مقاوم به خشکی گوجه فرنگی با روش PCR نیمه کمی abstract

کلسیم، یک جزء حیاتی مهم برای شماری از مسیر های انتقال پیام در گیاهان است که به واسطه انواعی از گیرنده های اختصاصی از جمله پروتئین های شبه کلسی نورین B (CBL) در درک تنش های محیطی، عمل می کند. در پژوهش حاضر، با رویکردهای بیوانفورماتیک، ۱۱ ژن رمزکننده پروتئین های شبه کلسی نورین B با درجه حفاظت شدگی زیاد در گیاه گوجه فرنگی شناسایی و تایید شد. با بهره گیری از یک روش مبتنی بر ارتوژنی، این پروتئین ها به ۵ کلاس مجزای SlCBL۱، SlCBL۳، SlCBL۴، SlCBL۸ و SlCBL۱۰ تقسیم بندی و نام گذاری شدند. تحلیل توالی های پروتئینی نشان داد که همه اعضای CBLهای ۱ و ۴ که شامل ۵ پروتئین می شوند، یک ناحیه حفاظت شده مریستویلاسیون در بخش N-ترمینال دارند. بررسی با روش PCR نیمه کمی نشان داد که میان CBLهای کلاس ۱، بیان ژن SlCBL۱-۳ در هردو تنش خشکی، حمله ویروس و ترکیب این دو، تنها در رقم حساس افزایش داشته است. درباره CBLهای کلاس ۳، اگرچه دو ژن SlCBL۳-۱ و SlCBL۳-۲ در تنش خشکی در هردو رقم حساس و مقاوم، افزایش بیان نشان دادند، اعمال هم زمان دو تنش، اثر افزایشی بر بیان این ژن ها نداشت. بین دو همولوگ کلاس ۴ نیز، تنها SlCBL۴-۱ در هردو تنش خشکی و ویروس افزایش بیان نشان داد. براساس نتایج، رفتار بیانی ژن های کلاسSlCBL۸ در شرایط مختلف تنش و ارقام مختلف، متنوع بود. بیان تنها ژن موجود در کلاس SlCBL۱۰ نیز در رقم حساس با هیچ کدام از تنش های یاد شده افزایش نیافت و تنها در رقم مقاوم، در تنش خشکی افزایش بیان داشت. به طورکلی، استنباط شد که با تغییر الگوی بیان ژن های CBL در هردو تنش زیستی و غیرزیستی، احتمالا مسیر های پیام رسانی CBL/CIPK متفاوتی در گیاهان حساس و مقاوم فعال می شوند.

بررسی میزان بیان ژن های خانواده CBL، در تنش خشکی و حمله ویروس در دو رقم حساس و مقاوم به خشکی گوجه فرنگی با روش PCR نیمه کمی Keywords:

بیان ژن , پروتئین های شبه کلسی نورین B , تنش خشکی , حمله ویروس , کلسیم , گوجه فرنگی

بررسی میزان بیان ژن های خانواده CBL، در تنش خشکی و حمله ویروس در دو رقم حساس و مقاوم به خشکی گوجه فرنگی با روش PCR نیمه کمی authors

پیمان آقائی

گروه زیست شناسی، دانشگاه پیام نور، صندوق پستی ۳۶۹۷-۱۹۳۹۵ تهران، ایران

محمدعلی ابراهیمی

گروه بیوتکنولوژی، دانشگاه پیام نور، تهران، ایران

سید علی حسینی تفرشی

گروه سلولی و مولکولی، دانشکده شیمی، دانشگاه کاشان، صندوق پستی ۵۳۱۵۳-۸۷۳۱۷ کاشان، ایران

مریم حائری نسب

گروه زیست شناسی، دانشگاه پیام نور، صندوق پستی ۳۶۹۷-۱۹۳۹۵ تهران، ایران

شکوفه انتشاری

گروه زیست شناسی، دانشگاه پیام نور، صندوق پستی ۳۶۹۷-۱۹۳۹۵ تهران، ایران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
Albrecht, V., Weinl, S., Blazevic, D., D'Angelo, C., Batistic, O., ...
Aravind, L., Mazumder, R., Vasudevan, S. and Koonin, E. V. ...
Batistic, O., Kim, K. N., Kleist, T., Kudla, J. and ...
Batistic, O. and Kudla, J. (۲۰۰۴) Integration and channeling of ...
Batistic, O. and Kudla, J. (۲۰۰۹) Plant calcineurin B-like proteins ...
Cheong, Y. H., Kim, K. N., Pandey, G. K., Gupta, ...
D'angelo, C., Weinl, S., Batistic, O., Pandey, G. K., Cheong, ...
Drerup, M. M., Schlücking, K., Hashimoto, K., Manishankar, P., Steinhorst, ...
Gu, Z., Ma, B., Jiang, Y., Chen, Z., Su, X. ...
Hamel, L. P., Nicole, M. C., Sritubtim, S., Morency, M. ...
Ho, C. H., Lin, S. H., Hu, H. C. and ...
Kim, B. G., Waadt, R., Cheong, Y. H., Pandey, G. ...
Kim, K. N., Cheong, Y. H., Gupta, R. and Luan, ...
Kleist, T. J., Spencley, A. L. and Luan, S. (۲۰۱۴) ...
Kolukisaoglu, Ü., Weinl, S., Blazevic, D., Batistic, O. and Kudla, ...
Kudla, J., Xu, Q., Harter, K., Gruissem, W. and Luan, ...
Luan, S. (۲۰۰۹) The CBL–CIPK network in plant calcium signaling. ...
Luan, S., Kudla, J., Rodriguez-Concepcion, M., Yalovsky, S. and Gruissem, ...
Mahajan, S., Sopory, S. K. and Tuteja, N. (۲۰۰۶) Cloning ...
Mao, J., Manik, S., Shi, S., Chao, J., Jin, Y., ...
Mohanta, T. K., Malnoy, M., Mohanta, N. and Kanchiswamy, C. ...
Mohanta, T. K. and Mohanta, N. (۲۰۱۳) Genome wide identification ...
Mohanta, T. K., Mohanta, N., Mohanta, Y. K., Parida, P. ...
Monihan, S. (۲۰۱۱) The Arabidopsis Calcineurin B-Like۱۰ calcium sensor couples ...
Pandey, G. K., Cheong, Y. H., Kim, K. N., Grant, ...
Pandey, G. K., Kanwar, P., Singh, A., Steinhorst, L., Pandey, ...
Qiu, Q. S., Guo, Y., Dietrich, M. A., Schumaker, K. ...
Quan, R., Lin, H., Mendoza, I., Zhang, Y., Cao, W., ...
Reddy, A. S., Ali, G. S., Celesnik, H. and Day, ...
Rudd, J. J. and Franklin‐Tong, V. E. (۲۰۰۱) Unravelling response‐specificity ...
Schlicker, A., Domingues, F. S., Rahnenführer, J. and Lengauer, T. ...
Shao, H., Chu, L., Jaleel, C. A. and Zhao, C. ...
Tang, R. J., Liu, H., Yang, Y., Yang, L., Gao, ...
Tang, R. J., Zhao, F. G., Garcia, V. J., Kleist, ...
Velásquez, A. C., Chakravarthy, S. and Martin, G. B. (۲۰۰۹) ...
Wang, M., Gu, D., Liu, T., Wang, Z., Guo, X., ...
Xu, J., Li, H. D., Chen, L. Q., Wang, Y., ...
Zhang, H., Yin, W. and Xia, X. (۲۰۰۸) Calcineurin B-Like ...
Zhu, J. K. (۲۰۰۲) Salt and drought stress signal transduction ...
Zhu, J. K. (۲۰۱۶) Abiotic stress signaling and responses in ...
نمایش کامل مراجع