شناسایی، تعیین توالی و ارزیابی پایداری بیان هشت ژن مرجع گیاه زعفران (.Crocus sativus L)

سید سجاد سهرابی; سید محسن سهرابی; سید کریم موسوی; محسن محمدی

شناسایی، تعیین توالی و ارزیابی پایداری بیان هشت ژن مرجع گیاه زعفران (.Crocus sativus L)

Publish place: Plant Genetic Researches، Vol: 7، Issue: 1

Publish Year: 1399

Type: Journal paper

Language: Persian

This Paper With 18 Page And PDF Format Ready To Download

DOWNLOAD Paper

Certificate
I'm the author of the paper

Export:

Link to this Paper:

https://civilica.com/doc/1225936

Document National Code:

JR_PGRLU-7-1_008

Index date: 8 June 2021

شناسایی، تعیین توالی و ارزیابی پایداری بیان هشت ژن مرجع گیاه زعفران (.Crocus sativus L) abstract

زعفران (.LCrocus sativus ) ارزشمندترین و گران ترین ادویه در سطح جهان است. کلاله های این گیاه منبع آپوکاروتنوئیدهای با ارزشی مانند کروسین، پیکروکروسین و سافرانال هستند. مطالعات ترنسکریپتومی و بیانی ژن ها یکی از مهم ترین مراحل در بررسی تولید متابولیت های ثانویه در گیاهان هستند. یکی از پیش نیازهای مهم در این گونه مطالعات، شناسایی ژن های مرجع قابل اعتماد و پایدار به منظور نرمال سازی بیان سایر ژن ها است. در پژوهش حاضر، با استفاده از ترنسکریپتوم گیاه زعفران هشت ژن مرجع شناسایی و تعیین توالی شد، سپس میزان پایداری بیان آن ها با استفاده از روش های غیرپارامتریک مورد بررسی قرار گرفت. نتایج تکثیر و توالی یابی، جداسازی صحیح هشت ژن مرجع Actin، EF۱، GAPDH، H۳، MDH، TBP، UBC و UBQ را از گیاه زعفران نشان داد. بررسی میزان پایداری بیان ژن های مرجع نشان داد که ژن های MDH و UBQ به ترتیب بیشترین میزان پایداری را بین بافت های مختلف گیاه زعفران داشته و کمترین میزان پایداری مربوط به ژن TBP بود. در این پژوهش توالی هشت ژن مرجع در زعفران جداسازی و پایداری بیان آن ها برای اولین بار در بافت های مختلف این گیاه سنجیده شد. ژن های مرجع شناسایی شده در این پژوهش می توانند به عنوان ژن های پایدار برای نرمال سازی بیان ژن ها در مطالعات ترنسکریپتومی گیاه زعفران به کار برده شوند.

شناسایی، تعیین توالی و ارزیابی پایداری بیان هشت ژن مرجع گیاه زعفران (.Crocus sativus L) Keywords:

Non-parametric statistics , Gene expression stability , Transcriptome , Saffron , Reference genes , آماره های غیرپارامتریک , پایداری بیان ژن , ترنسکریپتوم , زعفران , ژن های مرجع

شناسایی، تعیین توالی و ارزیابی پایداری بیان هشت ژن مرجع گیاه زعفران (.Crocus sativus L) authors

سید سجاد سهرابی

Lorestan University

سید محسن سهرابی

Department of Plant Production and Genetic Engineering, Faculty of Agriculture and Natural Resources, Lorestan University, Khorramabad, Iran

سید کریم موسوی

Plant Protection Research Division, Research Institute of Forests and Rangelands, Agricultural Research Education and Extension Organization (AREEO), Khorramabad, Iran

محسن محمدی

Department of Pharmaceutical Biotechnology and Pharmacognosy, Faculty of Pharmacy, Lorestan University of Medical Sciences, Khorramabad, Iran