شناسایی رونوشت های با افزایش تظاهر در رقم برنج (Oryza sativa L.) مقاوم به تنش شوری با استفاده از تکنیک cDNA-AFLP
Publish place: Journal of Crop Breeding، Vol: 9، Issue: 23
Publish Year: 1396
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 165
This Paper With 13 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JCB-9-23_014
تاریخ نمایه سازی: 17 مهر 1400
Abstract:
تنش شوری یکی از مهمترین تنشهای غیرزیستی برای برنج است که بهطور منفی رشد و باروری آن را متاثر میسازد. در این پژوهش اثرات تنش شوری بر بیان افتراقی برخی از ژنهای مسئول در تنش شوری در دو ژنوتیپ برنج متحمل و حساس به شوری (FL۴۷۸ و IR۲۹) با استفاده از تکنیک cDNA-AFLP مورد بررسی قرار گرفت. از میان TDFهای (Transcript Derived Fragments یا قطعات حاصل از رونوشتها) حاصل از ۲ آنزیم برشی و ۱۸ ترکیب آغازگری که در پاسخ به تنش شوری در رقم مقاوم در مقایسه با تیمار شاهد و حساس افزایش بیان نشان داده بودند ۲۸ TDF جدا شد که در نهایت ۲۱ عدد از آنها کلون، توالییابی و در بانک ژن ثبت گردیدند و سپس با استفاده از الگوریتم بلاست مورد آنالیز قرار گرفتند. TDFهای شناسایی شده در این مطالعه متعلق به گروههای متفاوتی از ژنها شامل متابولیسم، ترارسانی سیگنال، فاکتورهای رونویسی، سمیتزدایی، سیستم ترانسپورت و دیگر مکانیسمهای مرتبط با تنش شوری بودند که این امر بیانگر آن است که تعداد زیادی از فرآیندها در پاسخ به تنش شوری درگیر هستند. سپس تعدادی از این ژنها برای تائید الگوهای بیانی به دست آمده توسط cDNA-AFLP با استفاده از آنالیز Real time PCR انتخاب گردیدند که نتایج به دست آمده از این آزمایش الگوهای بیانی ردیابی شده با استفاده از تکنیک cDNA-AFLP را تائید نمود. نتایج این تحقیق نشان داد که cDNA-AFLP تکنیک قدرتمندی برای بررسی الگوی بیان ژنهای برنج تحت تنش شوری میباشد. علاوه بر این یافتههای ما به روشن نمودن اساس مولکولی اثرات تنش شوری بر ژنوم برنج و شناسایی ژنهایی که میتوانند تحمل به شوری برنج را افزایش دهند کمک مینماید.
Keywords:
CDNA-AFLP , Gene expression , Oryza sativa , Salt stress , Transcript , تنش شوری , cDNA-AFLP , رونوشت , بیان ژن , برنج
Authors
فاطمه زارع
Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University
غلامعلی رنجبر
Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University
علیرضا ترنگ
Agricultural Biotechnology Research and Institute Iran, Gilan branch, Agricultural Research, Training and Promotion Organization, Rasht, Iran
حمید نجفی زرینی
Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :