مکان یابی QTL های مرتبط با ویژگی های ریشه و اندام هوایی برنج در لاین های نوترکیب حاصل از تلاقی عنبربو × سپیدرود تحت تنش خشکی

Publish Year: 1396
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 178

This Paper With 19 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_CRGU-7-4_001

تاریخ نمایه سازی: 3 آبان 1400

Abstract:

به منظور شناسایی نواحی ژنومی مرتبط با تحمل به تنش خشکی با استفاده از روش تجزیه QTL، ۹۶ لاین F۸ مشتق از تلاقی بین دو رقم برنج ایرانی سپیدرود و عنبربو در مزرعه تحقیقاتی در منطقه آزاد شهر استان گلستان در سال زراعی ۱۳۹۰ کشت شدند. برای اعمال تنش خشکی از مرحله حداکثر پنجه­زنی تا زمان رسیدگی به فاصله ۲۰ روز آبیاری انجام شد. نقشه پیوستگی با استفاده از ۱۲۴ نشانگر ریزماهواره و ۲۶۴ نشانگر AFLP در آزمایشگاه ژنتیک و اصلاح نباتات دانشگاه گنبد کاووس تهیه شد که ۴/۱۹۵۰ سانتی­مورگان از ژنوم برنج را با متوسط فاصله ۲۰/۵ سانتی­مورگان بین نشانگرها پوشش داد. نتایج این مطالعه نشان داد که ناحیه­ای از کروموزوم ۲ در فاصله E۰۷۰-M۱۴۰-۱-E۰۷۰-M۱۵۰-۱۳، کروموزوم ۴ در فاصله E۰۶۰-M۱۶۰-۳-RM۱۳۵۹ و کروموزوم ۹ در فاصله E۱۲۰-M۱۴۰-۹-E۰۹۰-M۱۴۰-۱۴ کنترل چندین صفت را تحت شرایط تنش خشکی به عهده داشتند. این هم­مکانی QTLهای کنترل کننده چند صفت می­تواند نشان دهنده کنترل ژنتیکی یکسان آن­ها تحت شرایط تنش ­باشد. مکان­یابی QTLها نشان داد که QTLهای qDWRD-۲a، qDWRD-۴a، qRVD-۲، qRVD-۴a، qRND-۲a، qRND-۴a، qPND-۲a، qPND-۴، qPWD-۲، qPWD-۴، qSWD-۲a، qSWD-۴، qFRWD-۲، qFRWD-۴، و qPSPD-۹ بزرگ اثر بودند و بیش از ۲۰ درصد از تنوع فنوتیپی صفات را توجیه کردند. با توجه به اینکه این نواحی ژنومی سهم قابل توجهی از تغییرات فنوتیپی صفات را توجیه می­کنند، از این­رو پتانسیل استفاده از آن­ها در برنامه­های اصلاحی انتخاب به کمک نشانگر برای تحمل به خشکی پس از تعیین اعتبار آن­ها در جمعیت­های دیگر وجود دارد.

Authors

حسین صبوری

دانشیار، گروه تولیدات گیاهی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه گنبدکاووس، گنبدکاووس، ایران

شریفه محمدآلق

دانشجوی کارشناسی ارشد، گروه تولیدات گیاهی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه گنبد کاووس، گنبد کاووس، ایران

عبدالطیف قلی زاده

استادیار، گروه تولیدات گیاهی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه گنبد کاووس، گنبد کاووس، ایران

جعفر گیلکی

دانشجوی کارشناسی، گروه تولیدات گیاهی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه گنبد کاووس، گنبد کاووس، ایران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Ahamadi, J., Fotokian, M. H. and Fabriki-Orang, S. ۲۰۰۸. Detection ...
  • Ali, M. L., Pathan, M. S., Zhang, J., Bai, G., ...
  • Armenta-Soto, J., Chang, T. T., Loresto, G. C. and O’Toole, ...
  • Babu, R. C., Shashidhar, H. E., Lilley, J. M., Thanh, ...
  • Babu, R. C., Nguyen, B. D., Chamarerk, V., Shanmugasundaram, P., ...
  • Byrne, P. F. and McMullen, M. D. ۱۹۹۶. Defining genes ...
  • Champoux, M. C., Wang, G., Sarkarung, S., Mackill, D. J., ...
  • Chen, X., Temnykh, S., Xu, Y., Cho, Y. G. and ...
  • Clark, L. J., Price, A. H., Steele, K. A. and ...
  • Courtois, B., Shen, L., Petalcorin, W., Carandang, S., Mauleon, R. ...
  • Ekanayake, I. J., O’Toole, J. C, Carrity, D. P. and ...
  • Kamoshita, A., Zhang, J., Siopongco, J., Sarkarung, S., Nguyen, H. ...
  • Kamoshita, A., Wade, L., Ali, M., Pathan, M., Zhang, J., ...
  • Kato, Y., Hirotsu, S., Nemoto, K. and Yamagishi, J. ۲۰۰۸. ...
  • Khush, G. S. ۱۹۹۷. Origin, dispersal, cultivation and varation of ...
  • Lafitte, H. R., Yongsheng, G., Yan, S. and Li, Z. ...
  • Liu, B. H. ۱۹۹۸. Statistical genomics, linkage, mapping and QTL ...
  • Mambani, B. and Lal, R. ۱۹۸۳. Response of upland rice ...
  • Manly, K. F. and Olson, J. M. ۱۹۹۹. Overview of ...
  • McCouch, S. R., Teytelman, L., Xu, Y. B., Lobos, K. ...
  • Michael Gomez, S., Satheesh Kumar, S., Jeyaprakash, P., Suresh, R., ...
  • Nemoto, H. R., Suga, M. and Okutsu, Y. ۱۹۹۸. Deep ...
  • Nelson, J. C. ۱۹۹۷. QGENE: Software for marker-based genomic analysis ...
  • Nguyen, D. T., Nguyen, T. K. L., Pham, Q. C., ...
  • Nguyen, T. L. and Buu, C. B. ۲۰۱۰. Quantitative trait ...
  • Nicou, R., Seguy, L. and Haddad, G. ۱۹۷۰. Comparison of ...
  • O’Toole, J. C. and Bland, W. L. ۱۹۸۷. Genotypic variation ...
  • O’Toole, J. C. and Soemartono, N. ۱۹۸۱. Evaluation of a ...
  • Pflieger, S., Lefebvre, V. and Causse, M. ۲۰۰۱. The candidate ...
  • Price, A. H. and Tomos, A. D. ۱۹۹۷. Genetic dissection ...
  • Price, A. H., Steele, K. A., Moore, B. J., Barraclough, ...
  • Rafalski, J. A., Vogel, J. M., Morgante, M., Powell, W., ...
  • Ray, J. D., Yu, L., McCouch, S. R., Wang, G. ...
  • Sabouri, H., Sabouri, A. and Khatami Nejad, R. ۲۰۱۲. Mapping ...
  • Sabouri, H., Khanahmadi, A. R., Khataminejad, R., Jafarzadeh, M. R., ...
  • Saghai Maroof, M. A., Biyashev, R. M., Yang, G. P., ...
  • ۹۱: ۵۴۶۶-۵۵۷۰ ...
  • Sharma, S., Xu, S., Ehdaie, B., Hoops, A., Close, T. ...
  • Takeda, S. and Matsuoka, M. ۲۰۰۸. Genetic approaches to crop ...
  • Themnykh, S. D., Park, N. A, Cartinnour, N. H., Lipovhch, ...
  • Toorchi, M., Shashidhar, H. E, Sharma, N. and Hittalmani, S. ...
  • Trachsel, S., Kaeppler, S. M., Brown, K. M. and Lynch, ...
  • Venuprasad, R., Shashidhar, H. E., Hittalmani, S. and Hemamalini, G. ...
  • Vos, P., Hogers, R., Bleeker, M., Reijans, M., Lee, T ...
  • Wang, J. ۲۰۰۹. Inclusive composite interval mapping of quantitative trait ...
  • Xiao, J. H., Li, J. M., Yuan, L. P. and ...
  • Yadav, R., Courtois, B., Huang, N. and McLaren, G. ۱۹۹۷. ...
  • Yoshida, S. and Hasegawa, S. ۱۹۸۲. The rice root system: ...
  • Zheng, H. G., Babu, R. C., Pathanmd, M. S., Ali, ...
  • Zheng B. S., Yang, L., Zhang, W. P., Mao, C. ...
  • نمایش کامل مراجع