کاربردهای تعین ژنوتیپ با استفاده از توالی یابی ( GBS) در آبزی پروری با تکیه بر ماهیان خاویاری

تکثیر انتخابی بطور چشمگیری به عنوان مولفه اصلی در تولید پایدار گونه های آبزی در نظر گرفته شده است. استفاده ازتکنیکهای ژنومیک در تکثیر آبزیان به طور سنتی کمتر از سایر حیوانات اهلی مورد توجه قرار گرفته است. هرچند توسعه سریع و کاربرد تکنولوژیهای توالی یابی به آبزی پروری این اجازه را داده تا فاصله خود را با دامپروری کمک کند که این موضوع منجر به دسترسی منابع ژنومیکی بنیادین برای گونه های اصلی در آبزی پروری شده است. اگرچه اخیرا آرایه های با تراکم بالای SNP برای برخی از گونه ها توسعه یافته است، روشهای مستقیم تعیین ژنوتیپ با استفاده از توالی یابی بسیاری از پیشرفت های ژنتیک آبزیان و تکثیر را تحت تاثیر خود قرار داده است. به عنوان مثال، روش RAD-Seq و انواع مختلف آن بطور گسترده به منظور تولید دادههای SNP مبتنی بر جمعیت به کار رفتهاند. این روش های GBS وابسته به اطلاعات پیشین ژنومی مانند ژنوم مرجع برای گونه مدنظر نیستند. کاربردهای تکنیک RAD-Seq مواردی چون تهیه نقشه های لینکاژی، انجام مطالعات GWAS ، ارتقای جمع بندی ژنوم مرجع و اخیرا انتخاب بر مبنای اطلاعات ژنومیک برای صفت مورد دلخواه در آبزی پروری مانند رشد، تعیین جنسیت و مقاومت به بیماری را شامل میشود. این روشها امکان بررسی ژنوم را با هزینه ای کمتر نسبت به توالی یابی کل ژنوم فراهم می آورند و کشف نشانگر و تعیین ژنوتیپ به صورت همزمان رخ میدهد. یکی از فواید کاربردی روشهای GBS میتوان شناسایی نواحی ژنومی متمایز کننده اشاره کرد که این موضوع در ماهیان خاویاری نیز با توجه به سختی امر در شناسایی فنوتیپی آنها حائز اهمیت میباشد. این روشها میتوانند اطلاعات مناسبی در خصوص پویش مارکرهای مرتبط با جنسیت در ماهیان خاویاری در اختیار محققین قرار دهند. لذا به نظر میرسد به زودی تکنیکهای مختلف توالی یابی مبتنی بر NGS اطلاعات کاربردی زیادی را در خصوص ژنوم ماهیان خاویاری در اختیار قرار دهند.

Keywords:

آبزی پروری , تعیین ژنوتیپ , تکثیر انتخابی , RAD-Seq , SNP