Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings

Please waite ..
Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings
Login |Register |Help |عضویت کتابخانه ها
Paper
Title

شناسایی کل ریزماهواره ها در ژنوم شترهای دو کوهانه ایرانی با استفاده از داده های توالی یابی کل ژنوم

Year: 1400
COI: JR_JASR-13-1_011
Language: PersianView: 50
This Paper With 10 Page And PDF Format Ready To Download

Buy and Download

با استفاده از پرداخت اینترنتی بسیار سریع و ساده می توانید اصل این Paper را که دارای 10 صفحه است به صورت فایل PDF در اختیار داشته باشید.
آدرس ایمیل خود را در کادر زیر وارد نمایید:

Authors

ناهیده زارع - گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی- دانشگاه محقق اردبیلی، اردبیل، ایران
نعمت هدایت ایوریق - گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی- دانشگاه محقق اردبیلی، اردبیل، ایران
رضا سیدشریفی - گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی- دانشگاه محقق اردبیلی، اردبیل، ایران
رضا خلخالی - دکتری ژنتیک و اصلاح دام و طیور- دانشگاه محقق اردبیلی، اردبیل، ایران
آزاده بوستان - گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی- دانشگاه محقق اردبیلی، اردبیل، ایران.

Abstract:

شترهای دوکوهانه یکی از مقاومترین گونه های حیوانی در برابر شرایط سخت محیطی به شمار می روند که تعداد آنها در ایران در محدوده خطر قرار گرفته است. شناخت هر چه بهتر و دقیق تر این گونه، به خصوص در سطح مطالعات ژنومی، می تواند از طریق طراحی برنامه های مدیریت تنوع ژنتیکی، به حفظ این گونه کمک کند. هدف از انجام این مطالعه شناسایی ریزماهواره­های ژنوم شترهای دوکوهانه ایرانی با استفاده از داده­های توالی­یابی کل ژنوم بود. در مطالعه حاضر از تعداد شش نفر شتر دوکوهانه متعلق به استان اردبیل خون­گیری صورت گرفت. توالی­یابی کامل ژنوم شترهای دوکوهانه با استفاده از پلتفرم ایلومینا و به صورت دو انتها (Paired-end) با اندازه ۱۰۰ جفت باز از هر طرف انجام شد. بعد از پالایش کیفی خوانش ها، گردآوری از نو آنها صورت گرفته و با استفاده از برنامه MISA به شناسایی تمام ریزماهواره­های ژنوم های مورد مطالعه پرداخته شد. اندازه ژنوم های گردآوری شده برای شترهای دو­کوهانه مورد مطالعه، در محدوده Gb ۹۰/۱ برای نمونه یک تا Gb ۹۷/۱ برای نمونه سه قرار داشت. مقدار N۵۰ مربوط به کانتیگ­های ایجاد شده برای شترهای دو­کوهانه ایرانی از kb ۱/۱۹ برای نمونه یک تا kb ۷/۵۱ برای نمونه پنج متغیر بود. ریزماهواره­های شناسایی شده در اندازه یک تا هشت نوکلئوتید بودند. کل ریزماهواره­های شناسایی شده برای نمونه­های شترهای دو­کوهانه ایرانی در محدوده ۱۳۶۰۲۸ برای نمونه دو تا ۵۳۹۵۵۵ برای نمونه سه قرار داشت. همچنین با شناسایی ریزماهواره های هفت گونه پستاندار دیگر در این مطالعه، به مقایسه نتایج به دست آمده آنها با شتر دوکوهانه ایرانی پرداخته شد.

Keywords:

ایران , توالی یابی کل ژنوم , ریزماهواره , شتر دو کوهانه

Paper COI Code

This Paper COI Code is JR_JASR-13-1_011. Also You can use the following address to link to this article. This link is permanent and is used as an article registration confirmation in the Civilica reference:

https://civilica.com/doc/1413017/

How to Cite to This Paper:

If you want to refer to this Paper in your research work, you can simply use the following phrase in the resources section:
زارع، ناهیده و هدایت ایوریق، نعمت و سیدشریفی، رضا و خلخالی، رضا و بوستان، آزاده،1400،شناسایی کل ریزماهواره ها در ژنوم شترهای دو کوهانه ایرانی با استفاده از داده های توالی یابی کل ژنوم،https://civilica.com/doc/1413017

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :

  • Abdul-Muneer, P. ۲۰۱۴. Application of microsatellite markers in conservation genetics ...
  • Ala-Amjad, M., H. Yeganeh, and M. Sadeghi. ۲۰۱۷. Study of ...
  • Ali, T. A. ۱۹۹۴. A Manual for the Primary Animal ...
  • Beier, S., T. Thiel, T. Münch, U. Scholz, and M. ...
  • Bolger A. M., M. Lohse, and B. Usadel. ۲۰۱۴. Trimmomatic: ...
  • Ellegren, H. ۲۰۰۴. Microsatellites: simple sequences with complex evolution. Nature ...
  • Fitak, R. R., E. Mohandesan, J. Corander, and P. A. ...
  • Gemayel, R., J. Cho, S. Boeynaems, and K. J. Verstrepen. ...
  • Guang-Xin, E., Q. H. Hong, Y. J. Zhao, Y. H. ...
  • Hampton, J. O., P. B. S. Spencer, D. L. Alpers, ...
  • Huson, K. M., W. Haresign, M. Hegarty, T. Blackmore, C. ...
  • Ingram, D. L., and L. E. Mount. ۱۹۷۵. Man and ...
  • Jirimutu, Z. W., G. Ding, G. Chen, Y. Sun, Z. ...
  • Katti, M. V., P. K. Ranjekar, and V. S. Gupta. ...
  • Khalkhali-Evrigh, R.., S. H. Hafezian, N. Hedayat-Evrigh, A. Farhadi, and ...
  • Kelkar, Y. D., N. Strubczewski, S. E. Hile, F. Chiaromonte, ...
  • Leclercq, S., E. Rivals, and P. Jarne. ۲۰۱۰. DNA slippage ...
  • Schmidt-Nielsen, K. ۱۹۵۹. The physiology of the camel. Scientific American, ...
  • Schmidt-Nielsen, K. ۱۹۶۴. Desert Animals. Physiological Problems of Heat and ...
  • Subramanian, S., R. K. Mishra, and L. Singh. ۲۰۰۳. Genome-wide ...
  • Sun, W., C. Lei, X. Lei, and Y. Zhang. ۲۰۰۸. ...
  • Toth, G., Z. Gáspári, and J. Jurka. ۲۰۰۰. Microsatellites in ...
  • Wu, H., X. Guang, M. B. Al-Fageeh, J. Cao, S. ...

Research Info Management

Certificate | Report | من نویسنده این مقاله هستم

اطلاعات استنادی این Paper را به نرم افزارهای مدیریت اطلاعات علمی و استنادی ارسال نمایید و در تحقیقات خود از آن استفاده نمایید.

Scientometrics

The specifications of the publisher center of this Paper are as follows:
Type of center: دانشگاه دولتی
Paper count: 15,043
In the scientometrics section of CIVILICA, you can see the scientific ranking of the Iranian academic and research centers based on the statistics of indexed articles.

Share this page

More information about COI

COI stands for "CIVILICA Object Identifier". COI is the unique code assigned to articles of Iranian conferences and journals when indexing on the CIVILICA citation database.

The COI is the national code of documents indexed in CIVILICA and is a unique and permanent code. it can always be cited and tracked and assumed as registration confirmation ID.

Support