بررسی میزان بیان ژن های کلیدی در مسیر متابولیکی مهمترین ماده موثره گیاه کاکوتی ایرانی تحت تنش خشکی

هدف از این مطالعه بررسی اثر تنش خشکی بر متابولیت های ثانویه در مقایسه با شرایط عادی و همچنین بررسی بیان ژن هایمرتبط با مهمترین متابولیت های ثانویه گیاه کاکوتی میباشد. بدین منظور، با به کار گیری ابزارهای بیوانفورماتیکی بعضیخواص و ویژگی های پروتئین هایی که به وسیله ی ژن های مورد بررسی کد گذاری شده اند از جمله بررسی موقعیت درونسلولی پروتئین، بررسی خصوصیات فیزیکی و شیمیایی، پیش بینی سیگنال پپتیدهای بالقوه موجود در پروتئین ها و پیش بینیساختار فضایی پروتئین ها در ۴ ژن مذکور شناسایی و مورد ارزیابی قرار گرفت. همچنین گیاه کاکوتی در دو شرایط عادی وتنش خشکی کشت شد و سپس با استخراج RNA از بافت برگ این گیاه بیان ژن مورد نظر و مقایسه میزان بیان ژن درشرایط تنش خشکی به میزان FC؛ ۳۰% با نمونه شاهد انجام شد. تجزیه داده های حاصل از Real time PCR نشان داد که بیانژن لیمون سنتاز، ایزوپیپریتنول دهیدروژناز و نیز لیمون هیدروکسیلاز در شرایط تنش بیشتر از شاهد بود. همچنین میزان بیانژن ایزوپیپریتنول ریداکتاز در شرایط تنش کمتر از شرایط شاهد بود.

Keywords:

تنش خشکی , کاکوتی , ریل تایم