توالی یابی و آنالیز بیوانفورماتیکی ژن کاپا کازئین در جمعیت بزهای خلخالی ایران و سایر دام های اهلی
Publish place: Iranian Journal of Animal Science Research، Vol: 9، Issue: 2
Publish Year: 1396
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 234
This Paper With 11 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
Export:
Document National Code:
JR_JASR-9-2_006
Index date: 15 March 2022
توالی یابی و آنالیز بیوانفورماتیکی ژن کاپا کازئین در جمعیت بزهای خلخالی ایران و سایر دام های اهلی abstract
در سال های اخیر به طور عمده چند شکلی های ژنتیک پروتئین شیر مورد توجه و تحقیق بیشتری بوده است. زیرا بین پروتئین شیر و صفات اقتصادی مهم در دام رابطه مستقیم وجود دارد. کاپا کازئین به عنوان عمده ترین پروتئین موجود در شیر نقش مهمی در شکل گیری میسل های موجود شیر و کمک به افزایش حلالیت کلسیم و فسفر ایفا می کند، از این رو این مطالعه با هدف و رویکرد بررسی ژنتیکی و فیلوژنتیکی ناحیه اگزون ۴ ژن کاپا کازئین با روش توالی یابی در جمعیت بز خلخالی و مقایسه آن با سایر گونه ها انجام گرفت. نتایج حاصل از توالی های منجر به شناسایی یک جهش در نمونه های توالی یابی شده گردید که باعث تغییر نوکلئوتید C به T در جایگاه اگزون چهار ژن کاپا کازئین گردید که منجر به تغییر کدون CCT به TCT می شود و باعث جایگزینی اسید آمینه پرولین به جای سرین می شود. آنالیز تنوع ژنتیکی در جمعیت بز خلخالی ۵۲۴/۰ به دست آمدکه نشان دهنده تنوع ژنتیکی نسبتا مناسب می باشد. مقایسه توالی های جمعیت خلخالی با گونه های مختلف مانند بز، گاو ، گوسفند و گاو میش منجر به شناسایی ۴۱ جهش شد که ایجاد ۲۹ هاپلوتایپ مختلف با تنوع هاپلوتایپی ۸۳۳/۰ در گونه های مورد مطالعه می کند. تنوع نوکلئوتیدی و میانگین تفاوت نوکلئوتیدی (k) در بین گونه ها نیز به ترتیب برابر ۰۴۴۶۹/۰ و ۷۵۴۳۶/ ۱۱ به دست آمد.
توالی یابی و آنالیز بیوانفورماتیکی ژن کاپا کازئین در جمعیت بزهای خلخالی ایران و سایر دام های اهلی Keywords:
توالی یابی و آنالیز بیوانفورماتیکی ژن کاپا کازئین در جمعیت بزهای خلخالی ایران و سایر دام های اهلی authors
وحیده کریمی عوری
دانشگاه محقق اردبیلی
نعمت هدایت ایوریق
دانشگاه محقق اردبیلی
رضا سید شریفی
محقق اردبیلی
سعید نیک بین
محقق اردبیلی
یونس زاهدی
محقق اردبیلی
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :