بررسی ارتباط محتوی GC با سایز ژنوم کلروپلاستی و گونه ی میزبان

یکی از مهم ترین عملکردهای کلروپلاست، تولید ترکیبات قندی است که به عنوان سوخت اصلی برای متابولیسم سلول های غیر فتوسنتز استفاده می شود. از این رو، مقایسه ژنومیک انواع مختلف ژنومهای کلروپلاست یکی ازروش های بیوانفورماتیکی است که منجر به درک و سازوکار تکاملی کلروپلاست در ارگانیزم های مختلف می شود و می تواند گام بزرگی برای عملی کردن اصلاح مولکولی کلروپلاست به منظور افزایش راندمان باشد از جمله مواردی که در ژنومیک مقایسه ای ارزیابی می گردد میزان محتوی GC است، به این منظور خصوصیات ژنومی، محتوای GC ژنوم های کلروپلاستی ورابطه ی آن با نوع گیاه میزبان در ۱۲ ارگانیزم ازدو گروه : دو لپه L.esculentum, N.tabacum,، A.Hypochondriacus, H.ammodendron, P.oleracea ، S.tuberosum و تک لپه O.sativa, H.vulgare, T.aestivum, S.bicolor, Z.mays، S.officinarum,، مورد بررسی قرار گرفتند. نتایج به دست آمده نشان داد که محتوی GC بسته به این که گیاه میزبان تک لپه دو لپه باشد متغیر است، به طوریکه در گیاهان تک لپه محتوای GC بیشتر می باشد. به نظرمی رسد درتک لپه ها محتوای GC بالاتر با افزایش تحمل وتوانایی رشد درمناطق دارای زمستان سرد ویادارای کمبود آب فصلی (خشکسالی فصلی) همراه بوده است. همچنین نتایج بیانگر همبستگی منفی محتوای GC با سایز ژنومی است، به طوریکه با افزایش سایز ژنوم محتوی GC کم تر می شود.

Keywords:

محتوی , GC , کلروپلاست , ژنومیک مقایسه ای , سایز ژنومی , بیوانفورماتیک