ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

شناسایی ریز RNA های نامزد دخیل در تحمل سرما در نخود زراعی

Publish place: Journal Of Genetic Engineering and Biosafety، Vol: 11، Issue: 1
Publish Year: 1401
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 162

This Paper With 12 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:
https://civilica.com/doc/1617727

شناسه ملی سند علمی:

JR_GEB-11-1_004

تاریخ نمایه سازی: 15 اسفند 1401

Abstract:

نخود (Cicer arietinum) یکی از مهمترین حبوبات است که حساس به سرما بوده و هر ساله کاهش ناگهانی دما منجر به افت عملکرد قابل توجه آن می­شود. ریزRNA­ها، RNA­های کوچک غیررمزکننده بسیار محافظت­ شده­ ای هستند که بیان ژن را با تخریب mRNA­های هدف پس از رونویسی یا سرکوب ترجمه آنها تنظیم می­کنند و نقش آن­ها در پاسخ به سرما در گیاهان مختلف به اثبات رسیده است. در این مطالعه، به منظور شناسایی ریزRNA­های پاسخ دهنده به سرما، پس از توالی­ یابی ترانسکریپتوم در یک رقم متحمل (سارال) و یک لاین حساس به تنش سرما (ILC۵۳۳)، توالی ژن­های پاسخ دهنده به تنش سرما در نخود با استفاده ازنرم افزار c-mii مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. سپس، ژن­های هدف تعدادی از ریزRNA­های مهم با استفاده از نرم­افزار psRNA Target تعیین شدند. نتایج نشان داد که ۳۰ ریزRNA در ژنوتیپ متحمل و ۲۰ ریزRNA در ژنوتیپ حساس نخود به تنش سرما پاسخ دادند. با مقایسه پاسخ ریزRNA­ها در دو ژنوتیپ مورد بررسی، ریزRNA­هایmiR۱۵۹ ،miR۳۱۹ ، miR۳۹۳ و  miR۳۹۴ به عنوان ریزRNA­های نامزد دخیل در تحمل سرما در نخود تعیین و نقش آنها مورد بررسی دقیق ­تر قرار گرفت. امید است نتایج به دست آمده در راستای ایجاد ارقام نخود متحمل به سرما مفید واقع شود.

Keywords:

Cicer arietinum , small noncoding RNAs , Cold responsive , Target genes , نخود زراعی , پاسخ دهنده به سرما , RNA های کوچک غیررمزده , ژن های هدف

Authors

علیرضا اکبری

Department of Plant Production and Genetic Engineering, Faculty of Agriculture, Lorestan University, Khorramabad, Iran.

احمد اسماعیلی*

Department of Plant Production and Genetic Engineering, Faculty of Agriculture, Lorestan University, Khorramabad, Iran.

زهرا سادات شبر

Department of Systems Biology, Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran (ABRII), Agricultural Research, Education and Extension Organization, Karaj, Iran

نازنین امیربختیار

Seed and Plant Improvement Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization, Karaj, Iran

معصومه پوراسماعیل

Seed and Plant Improvement Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization, Karaj, Iran

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Akhtar M, Jaiswal A, Taj G, Jaiswal JP, Qureshi MI, ...
  • Allen RS, Li J, Alonso P, Maria MW, Rosemary G, ...
  • Bartel DP. ۲۰۰۴. MicroRNAs: genomics, biogenesis, mechanism, and function. cell ...
  • Blázquez MA, Nelson. DC, Weijers D. ۲۰۲۰. Evolution of plant ...
  • Carrington JC, Ambros V. ۲۰۰۳. Role of microRNAs in plant ...
  • Chen L. ۲۰۱۲. Genome-wide identification of cold-responsive and new microRNAs ...
  • Cheng Z, Lei N, Li S, Liao W, Shen J, ...
  • Cheshmehnoor M, Behamta MR, Shahnejat AA, Abbasi R, Alizadeh B ...
  • Curaba J, Singh.MB, Bhalla.PL. ۲۰۱۴. miRNAs in the crosstalk between ...
  • Ding Y, Shi Y, Yang S. ۲۰۱۹. Advances and challenges ...
  • Gao J, H. Chen, H. Yang, He. Y, Tian.Z, Li ...
  • Garg R, Bhattacharjee A, Jain M. ۲۰۱۵. Genome-scale transcriptomic insights ...
  • Gil J, Nadal S, Luna D, Moreno MT, Haro A. ...
  • Ibrikci H, Sharon JB, Michael AG. ۲۰۰۳. Chickpea leaves as ...
  • Jain M, Misra G, Patel K, Priya P, Jhanwar S, ...
  • Kiran A, Kumar S, Nayyar H, Sharma KD. ۲۰۱۹. Low ...
  • Lee RC, Feinbaum RL, Ambros V. ۱۹۹۳. The C. elegans ...
  • Li T, Gonzalez N, Inzé D, Dubois M. ۲۰۲۰. Emerging ...
  • Liu Q, Yan S, Yang T, Zhang S, Chen YQ, ...
  • López G, María J, García R, Inmaculada GH, Ana I, ...
  • Numnark S, Mhuantong W, Ingsriswang S, Wichadakul D. ۲۰۱۲. C-mii: ...
  • Prakash P, Ghosliya D, Gupta V. ۲۰۱۵. Identification of conserved ...
  • Qin Y, Wang M, Tian Y, He W, Han L, ...
  • Reyes JL, Chua NH. ۲۰۰۷. ABA induction of miR۱۵۹ controls ...
  • Singh D, Sinha V, Kumar A, Teotia S. ۲۰۲۰. Small ...
  • Singh P, Dutta.P, Chakrabarty.D. ۲۰۲۱. miRNAs play critical roles in ...
  • Sohrabi SS, Ismaili A, Nazarian F, F Hossein (۲۰۲۰). Identification ...
  • Song G, Zhang R, Zhang S, Li Y, Gao J, ...
  • Song J, Bo G, Shuai W, Ye L, Bo WZ, ...
  • Teotia S, Singh D, Tang G. ۲۰۱۷. DNA Methylation in ...
  • Tian X, Song L, Wang Y, Jin W, Tong F, ...
  • Vannini C, Locatelli F, Bracale M, Magnani E, Marsoni M, ...
  • Wang W, Shi T, Ni X, Xu Y, Qu S, ...
  • Wu ZJ, Wang WL, Zhuang J. ۲۰۱۷. TCP family genes ...
  • Xia K, Wang R, Ou X, Fang Z, Tian C, ...
  • Xiong L, Schumaker KS, Zhu JK. ۲۰۰۲. Cell signaling during ...
  • Yanai O, Shani E, Russ D. Ori N. ۲۰۱۱. Gibberellin ...
  • Yousefi V, Ahmadi J, Sadeghzadeh AD, Esfandiari E. ۲۰۱۸. Influence ...
  • Yuan W, Suo J, Shi B, Zhou C, Bai B, ...
  • Zhou X, He F, Liu F, Zheng X, Di C, ...
  • Zhou X, Wang G, Sutoh K, Zhu JK, Zhang W. ...
    • نمایش کامل مراجع