همسانه سازی و بررسی ویژگی های ساختاری ژن کنترل کننده گلدهی AGL۶ در سیر گلده ایرانی

اکثر ارقام تجاری سیر غیر گلده و عقیم می باشند. درک صحیح از ساختار ژن AGL۶ به عنوان یک ژن کنترلکننده گلدهی و باروری در انواع گلده و زایای سیر، روند برنامه های اصلاحی این گیاه دارویی با ارزش را بهبود می بخشد. بدین منظور ابتدا بیان نسبی این ژن در اندامهای مختلف سیر با استفاده RT-PCR بررسی شد. سپس بخشی از ژن AGL۶ با استفاده از تکنیک RT-PCR از گلچه های سیر ایرانی جداسازی و همسانه سازی شد. نتایج حاصل از توالی یابی پلاسمید نوترکیب با استفاده از نرم افزار Vector NTI و ORF finder مورد بررسی قرار گرفت . در نهایت توالی نوکلئوتیدی و پروتئینی به دست آمده در این تحقیق با نرم افزار بلاست واقع در وب سایت NCBI هم ردیف و ویژگی های ساختاری آن مشخص گردید. بر اساس نتایج به دست آمده قطعه همسانه سازی شده کدکننده ژن AsAGL۶ به طول ۷۲۸ جفت باز می باشد. بررسی توالی آمینواسیدی و موتیف های ساختاری ژن AsAGL۶ نشان داد که این توالی نوکلئوتیدی یک پروتئین با ۲۴۳ اسید آمینه را کد می کند به طوریکه نوکلئوتید۷ تا ۱۹۷ کد کننده دومین MADS-box و نوکلئوتید ۲۴۳ تا ۵۰۹ کد کننده دومین K-box می باشند. بلاست توالی نوکلئوتیدیژ پروتئینی توالی حاضر نیز تشابه بالای ۹۰ درصد را با توالی مربوط به ژن AGL۶ در سایر گیاهان تک لپه ای نظیر پیاز، لیلیوم و گل نرگس نشان داد.

Keywords:

AGAMOUS- Like ۶ , Allium sativum , باروری