ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

مطالعه بیان ژن های مسیر پیام رسانی در واکنش به تنش شوری بالا در گیاهچه های برنج (.Oryza sativa L)

Publish place: Environmental Stresses in Crop Sciences، Vol: 16، Issue: 3
Publish Year: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 42

This Paper With 10 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:
https://civilica.com/doc/1807149

شناسه ملی سند علمی:

JR_ESCS-16-3_003

تاریخ نمایه سازی: 10 آبان 1402

Abstract:

به دلیل حساسیت بالا، رشد و نمو و عملکرد گیاه برنج تحت تاثیر تنش شوری به شدت کاهش می یابد. درک وقوع تنش و اتخاذ واکنش های اسمزی و یونی نیازمند درگیر کردن مسیرهای پیام رسانی است. در تحقیق حاضر یک مطالعه RNA-Seq به منظور مطالعه بیان ژن های درگیر در مسیر پیام رسانی تنش شوری در برنج صورت پذیرفت. بدین منظور ارقام حساس IR۲۸ و متحمل CSR۲۸ پس از جوانه زنی و کشت در محیط کشت هیدروپونیک، تحت تیمار شوری ۱۵۰ میلی مولار قرار گرفتند و پس از ۶ و ۵۴ ساعت از وقوع تنش، نمونه برداری از اندام های ریشه و هوایی انجام شد. از ۴۸ نمونه توالی یابی شده در مجموع ۱۵۴۸۳ ژن دارای بیان افتراقی بودند که تجزیه مسیر MapMan توانست ۹۱ ژن درگیر در مسیر پیام رسانی را با مقایسه ارقام حساس و متحمل در شرایط اختصاصی تنش شوری شناسایی کند که ۲۷ ژن دارای بیان بالا بودند. بیشترین اختلاف ارقام مربوط به زمان ۵۴ ساعت و اندام ریشه بود که در ۲۱ ژن رقم متحمل بیان بالاتری نسبت به رقم حساس داشت. بررسی نوع ژن های پیام رسان نشان داد که پروتئین های کینازی بیشترین سهم را داشتند. ژن های OsSIK۱، OsSAPK۴، OsCIPK۰۵، OsCIPK۱۴، OsCBL۴ و OsPP۲C۱ از مهم ترین ژن های درگیر در پیام رسانی بودند که در تحقیق حاضر بیان بالاتری در رقم متحمل CSR۲۸ نسبت به رقم حساس IR۲۸ داشتند. شناسایی ژن های درگیر در مسیرهای پیام رسانی و آگاهی از نحوه تعامل آن ها، کمک شایانی به اصلاحگران به منظور انتخاب و توسعه ارقام برنج متحمل به تنش شوری خواهد کرد.

Keywords:

Authors

مژده اکبرزاده للکامی

دانشجوی سابق دکتری، گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشکده تولید گیاهی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان، گرگان

محمد هادی پهلوانی

دانشیار گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشکده تولید گیاهی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان، گرگان

خلیل زینلی نژاد

استادیار گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشکده تولید گیاهی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان، گرگان

کیوان مهدوی ماشکی

استادیار پژوهش موسسه تحقیقات برنج کشور، معاونت مازندران، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، آمل

آندریاس پی.ام وبر

استاد گروه بیوشیمی گیاهی، دانشگاه HHU، دوسلدورف، آلمان

دومینیک بریل هاوس

استادیار گروه بیوشیمی گیاهی، دانشگاه HHU، دوسلدورف، آلمان

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Akbarzadeh Lelekami, M., Pahlevani, M. H., Zaynali Nezhad, K., Mahdavi ...
  • Andrews, S., ۲۰۱۰. FastQC: a quality control tool for high ...
  • Bolger, A. M., Lohse, M., Usadel, B., ۲۰۱۴. Trimmomatic: a ...
  • Chen, X. F., Gu, Z. M., Feng, L., Zhang, H. ...
  • Chinnusamy, V., Jagendorf, A., Zhu, J. K., ۲۰۰۵. Understanding and ...
  • Cotsaftis, O., Plett, D., Johnson, A. A., Walia, H., Wilson, ...
  • Howe, E. A., Sinha, R., Schlauch, D., Quackenbush, J., ۲۰۱۱. ...
  • Hunter, M. C., Smith, R. G., Schipanski, M. E., Atwood, ...
  • Jung, S.E., Bang, S.W., Kim, S.H., Seo, J.S., Yoon, H.-B., ...
  • Kobayashi, Y., Yamamoto, S., Minami, H., Kagaya, Y., Hattori, T., ...
  • Lim, C.W., Yang, S.H., Shin, K.H., Lee, S.C., Kim, S.H., ...
  • Luan, S., ۲۰۰۳. Protein phosphatases in plants. Annual Review of ...
  • Luan, S., ۲۰۰۹. The CBL–CIPK network in plant calcium signaling. ...
  • Mansuri, R.M., Shobbar, Z.S., Jelodar, N.B., Ghaffari, M.R., Nematzadeh, G.A., ...
  • Mantri, N., Patade, V., Penna, S., Ford, R., & Pang, ...
  • Martínez-Atienza, J., Jiang, X., Garciadeblas, B., Mendoza, I., Zhu, J.-K., ...
  • Miyakawa, T., Hatano, K.I., Miyauchi, Y., Suwa, Y.I., Sawano, Y., ...
  • Nagy, E.D., Lee, T.C., Ramakrishna, W., Xu, Z., Klein, P.E., ...
  • Naithani, S., Dikeman, D., Garg, P., Al-Bader, N., Jaiswal, P., ...
  • Nongpiur, R.C., Singla-Pareek, S.L., Pareek, A., ۲۰۲۰. The quest for ...
  • Ouyang, S.Q., Liu, Y.F., Liu, P., Lei, G., He, S.J., ...
  • Qiu, Q.S., Guo, Y., Dietrich, M.A., Schumaker, K.S., Zhu, J.K., ...
  • Reddy, A. S., ۲۰۰۱. Calcium: silver bullet in signaling. Plant ...
  • Saijo, Y., Hata, S., Kyozuka, J., Shimamoto, K., Izui, K., ...
  • Schweighofer, A., Hirt, H., Meskiene, I., ۲۰۰۴. Plant PP۲C phosphatases: ...
  • Shiu, S.H., Karlowski, W.M., Pan, R., Tzeng, Y. H., Mayer, ...
  • Singh, A., Giri, J., Kapoor, S., Tyagi, A.K., Pandey, G.K., ...
  • Thimm, O., Bläsing, O., Gibon, Y., Nagel, A., Meyer, S., ...
  • Todaka, D., Nakashima, K., Shinozaki, K., Yamaguchi-Shinozaki, K., ۲۰۱۲. Toward ...
  • Trapnell, C., Pachter, L., Salzberg, S.L., ۲۰۰۹. TopHat: discovering splice ...
  • Trapnell, C., Williams, B.A., Pertea, G., Mortazavi, A., Kwan, G., ...
  • Trapnell, C., Roberts, A., Goff, L., Pertea, G., Kim, D., ...
  • Trapnell, C., Hendrickson, D. G., Sauvageau, M., Goff, L., Rinn, ...
  • Vij, S., Giri, J., Dansana, P.K., Kapoor, S., Tyagi, A.K., ...
  • Walia, H., Wilson, C., Zeng, L., Ismail, A.M., Condamine, P., ...
  • Wang, C., Li, D., Wang, P., Chen, D., Chen, X., ...
  • Xiang, Y., Huang, Y., Xiong, L., ۲۰۰۷. Characterization of stress-responsive ...
  • Yoshida, S., Forno, D.A., Cock, J. H., ۱۹۷۱. Laboratory manual ...
  • You, J., Zong, W., Hu, H., Li, X., Xiao, J., ...
    • نمایش کامل مراجع