بررسی اپی توپ های خطی و کونفورماسیونی پروتئین bauA در اسینتوباکتر بومانی

اسینتوباکتربومانی به عنوان یکی از مقاوم ترین باکتری های گرم منفی به مواد ضد میکروبی برای درمان و کنترل شناسایی شده است. باکتری های بیماری زا برای مقابله با محدودیت فقر آهن در میزبان انسانی، پروتئین های خاصی را در غشای خارجی خود بیان و نیز ترکیبات خاصی به نام کلیت کننده های آ]ن را به بیرون از سلول ترشح می کند. آنتی بادی تولید شده بر علیه این پروتئین ها، با بلوکه کردن مسیر جذب آهن می تواند اثر باکتری سیدال یا باکتری استاتیک اعمال کند. مشخصه یک آنتی ژن برای اتصال اختصاصی به آنتی بادی به عنوان آنتی ژنسیته آن در نظر گرفته می شود و بعلاوه توانایی آن آنتی ژن برای برانگیختن پاسخ های ایمنی قدرت ایمونوژنسیته آن آنتی ژن نامیده می شود. تلاش برای کشف پپتیدهایی که می توانند اپی توپ های پروتئین را تقلید و پاسخ ایمنی مشابهی با پروتئین کامل را ایاد کنند بسیار ائز اهمیت می باشد. بنابراین روش های تئوری برای پیش گویی اپی توپ ها گسترش زیادی یافته است که منجر به سنتز پپتیدهایی شده که از نظر تست های تشخیصی ایمنی و نیز تولید واکسن اهمیت زیادی دارند. مطالعه حاضر برای کنترل و یا ممانعت از گسترش عفونت های ناشی از اسینتوباکتربومانی طراحی شده است. ما از ابزارهای بیوانفورماتیک برای مطالعه و توصیف بهتر ساختار bauA از اسینتوباکتربومانی و نیز انتخاب نواحی مناسب به عنوان اپی توپ سلول B مؤثر بهره برده ایم.

Keywords:

اسینتوباکتربومانی , آهن , بیوانفورماتیک , اپی توپ