بهبود الگوریتم درخت چرخش برای پیشبینی اهداف میکروآران ای با استفاده از الگوریتم ژنتیک

میکرو آر انای ها 1 یک کلاس از آر ان ای های کوچک غیرکدشونده تنظیمی هستند که اهمیت بسیار زیادی در خاموش کردن ژن های پست-ترنسکریپشنال دارند. آنها اکثرا با چسبیدن به بخشUTR3 مسنجر آر ان ای های هدف، میزان ژنها را به یکای از دو روش بریدن یا مهار کردن تنظیم می کنند. دانشمندان در ابتدا اهداف میکرو آر ان ای ها را با انجام آزمایش مشخص می کردند. با این وجود، بخاطر پرهزینه و زمانبر بودن این آزمایشات و نبود روش های آزمایشگاهی خروجی بالا استفاده از تکنیک های محاسباتی برای پیش بینی اهداف میکرو آر ان ای ها اجتناب ناپذیر است. چندین روش برای پیشبینی اهداف میکرو آر ان ای ها ارائه شده است. دراین مقاله یک روش جمعی جدید بر اساس درخت چرخش برای پیشبینی اهداف میکرو آر ان ای ها ارائه شده است.اولین نوآوریاستفاده از دستهبندهای مختلف برای ساخت دستهبند جمعی است. دومین بهبود بهینهسازی پارامترهای درخت چرخش با استفاده از الگوریتم ژنتیک میباشد.روش پیشنهادی با روشهایی که اخیرا توسعه داده شده مقایسه شد. نتایج نشان داد که روش پیشنهادی ما کارایی رادر مقایسه با مطالعات قبلی بهبود داده است

Keywords:

پیشبینی اهداف میکرو آر ان ای , یادگیری جمعی , الگوریتم ژنتیک