بررسی احتمال پاسخ متغیر نشانگر RAPD در نتیجه کاربرد آغازگرهای متفاوت بمنظور تمایز جمعیت های پسیل پسته
Publish place: 2nd National Conference on New Concepts in Agriculture
Publish Year: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 632
This Paper With 5 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NCNCA02_259
تاریخ نمایه سازی: 14 شهریور 1393
Abstract:
در این پژوهش احتمال نتایج متفاوت نشانگر RAPD از طریق کاربرد آغازگرهایی متفاوت نسبت به پژوهش های قبلی بررسی شد. گونه مورد آزمایش، پسیل پسته Agonoscena pistaciae، مهمترین آفت درختان پسته بود که تنوع ژنتیکی جمعیت های مختلف آن مورد بررسی قرار گرفت. جمعیت ها از استان های فارس، اصفهان، مرکزی، قزوین، کرمان، سمنان، خراسان رضوی، یزد و خراسان جنوبی جمع آوری شدند. پس از بهینه سازی شیوه استخراج DNA، تک نمونه ها مورد استفاده قرار گرفتند. ده آغازگر متفاوت RAPD شامل OPA06، OPA07، OPA08، OPA09 و OPA10 (از گروه OPA) و همچنین OPB01، OPB02، OPB03، OPB04 و OPB05 (از گروه OPB) بودند. واکنش PCR در 35 چرخه با شرایط دمای و زمانی °C94 بمدت یک دقیقه، C 38 بمدت یک دقیقه و ° C 72 بمدت یک دقیقه بود. الکتروفورز محصولات PCR نشان داد که همه آغازگرها نوارهای قابل امتیازدهی (در مجموع 273 نوار) ایجاد کردند. از مجموع باندهای ایجاد شده 96 درصد (264باند) چند شکلی نشان دادند. آنالیز و گروه بندی داده ها با استفاده از نرمافزار NTSYS-PC نشان داد که جمعیت ها به دو شاخه اصلی تقسیم شدند. در این گروه بندی جمعیت کرمان در یک شاخه مجزا قرار گرفت. در ضریب تشابه 72 درصد نیز جمعیتهای خراسان رضوی و مرکزی از سایر جمعیتها جدا شدند. با مبنا قرار دادن نشانگر RAPD دو جمعیت استان های خراسان جنوبی و اصفهان بیشترین شباهت را نشان دادند. نتایج نشان داد که استفاده از آغازگرهای متفاوت باعث ایجاد گروه بندی و تمایزهای متفاوت می شود
Keywords:
Authors
حمیده نادی
دانشجوی کارشناسی ارشد حشره شناسی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
محمود محمدی شریف
استادیار گروه گیاهپزشکی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
علیرضا هادی زاده
استادیار گروه گیاهپزشکی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
معصومه شایان مهر
استادیار گروه گیاهپزشکی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :