بررسی کمپلکس های پروتئینی و متابولیت های برنج تحت تنش شوری(NaCl)

شوری یک فاکتور محدود کننده تولید برنج در سراسر دنیاست. بسیاری از فرایند های پیچیده سلولی ، بیشتر از آن که به وسیله پروتئین های منفرد انجام گیرند، به وسیله مجموعه ای از مولکول های پروتئینی صورت می گیرند. بنابراین شناسایی و تعیین خصوصیتکمپلکس های پروتئینی در شناسایی شبکه پروتئین های متقابل که پاسخ برنج به شوری را تنظیم می کنند، موثر می باشند. بنابراین در این آزمایش کمپلکس های پروتئینی اندام هوایی برنج در پاسخ به تنش شوری با روش BN-PAGE و سپس روش طبع برگشتگیSDS-PAGE مطالعه شدند. با استفاده از این روش، کمپلکس های پروتئینی کل سلول با استفاده از دترجنت ضعیف در بافر حل کننده، در دو ژنوتیپ برنج29 حساس به شوری وFL478 متحمل به شوری) تحت شرایط کنترل و تنش آنالیز شدند. سپس کمپلکس های جدا شده روی ژلSDS-PAGEجدا و با اسپکترومتری جرمیMALDI TOF/TOFشناسایی شدند. در این مطالعه 9 پروتئین کمپلکس به عنوان هتروالیگومر و 9 پروتئین به عنوان کمپلکس هموالیگومر از طریق بانک اطلاعاتی STRINGشناسایی شدند در حالی که 10 پروتئین به عنوان منومر مهاجرت کردند. مهمترین کمپلکس های هتروالیگومری ردیابی شده در این مطالعه شامل زیرواحدهای پروتئینی متعلق به فتوسیستمcytochrome b6f و ATP synthase ،II و Iبودند. علاوه بر کمپلکس های پروتئینی شناسایی شده، چندین اثرمتقابل پروتئینی جدید نیز در این مطالعه معرفی گردید. تغییرات الگوی پروتئوم دو ژنوتیپ در پاسخ به شوری نشان داد که از میان 76 پروتئین شناسایی شده، 32 پروتئین تغییرات معنی داری در پاسخ به تنش نشان دادند

Keywords:

کمپلکس های پروتئینی , تنش شوری , پروتئین های هموالیگومر , پروتئین های هتروالیگومر , پروتئین های مونومر