ارزیابی الگوهای پروتئینی پنبه با استفاده از الکتروفورز ژل پلی آکریلامید (SDS-PAGE)

پنبه یکی از مهم ترین و با ارزش ترین محصولات کشاورزی است که در بیش از یکصد کشور جهان کشت می شود. الکتروفورز پروتئین های ذخیرهای بذر ابزار سودمندی جهت شناسایی تنوع و بررسی قرابت افراد می باشد. در تحقیق حاضر، پروتئین های محلول در آب و نمک بذر 28 رقم پنبه استخراج و پس از انجام الکتروفورز، نوارهای حاصل نمره دهی و مورد تجزیه قرار گرفت. نتایج نشان داد که در مجموع برای ارقام مورد مطالعه، 22 نوار پروتئینی وجود دارد که در این بین، ارقام ساحل، شیرپان 539 و موتاژنز بیشترین و رقم هیبرید ورامین 349 کمترین تعداد نوار را داشت. تجزیه خوشه ای با استفاده از ضریب تطابق ساده و به روش UPGMA ارقام مورد مطالعه را به چهار گروه تقسیم کرد. همچنین، تجزیه به مولفه های هماهنگ اصلی نشان داد که سه مولفه هماهنگ اول 86/73 درصد از کل واریانس داده ها را توجیه می کنند. همچنین طبق اطلاعات بدست آمده از برآورد شاخص تنوع ژنی نی، 18 مکان ژنی دارای چند شکلی و چهار مکان بصورت مونومورف بودند. بنابراین، وجود تنوع قابل ارزیابی با استفاده از الکتروفورز پروتئین های ذخیره ای بذر، امکان استفاده از این نشانگرها را برای برنامه های اصلاحی مختلف میسر خواهد ساخت.

Keywords:

پنبه , پروتئین های ذخیره ای بذر , تجزیه خوشه ای , تجزیه به مولفه های هماهنگ اصلی , SDS-PAGE