تغییرات ساختاری ژنهای مقاومت به زنگ قهوهای در ارقام مقاوم و حساس گندم نان (Leaf rust)

زنگ قهوهای بوسیله قارچ اپیدمی آن منجر به کاهش شدید عملکرد و کیفیت گندم نان میشود. ایجاد میشود و یکی از بیماریهای مهم گندم در سطح جهان است که Puccinia triticina در این مطالعه تغییرات ساختاری و تنوع نوکلئوتیدی برخی از ژنهای مقاومت به زنگ قهوهای در هفت ژنوتیپ گندم نان با درجات متفاوت مقاومت بررسی شد. ژنهای مقاومت به زنگ قهوهای و یا نواحی پیوسته با این ژنها با استفاده از آغازگرهای اختصاصی طراحی شده بر اساس توالیهای موجود در بانک همسانهسازی و توالییابی شدند. همردیف کردن توالی ژنهای E. coli های اطلاعاتی تکثیر شدند. قطعات تکثیری در باکتری شباهت بالای آنها را با توالی ژنهای مقاومت از جمله ژن ،NCBI جداسازی شده با توالیهای موجود در بانکهای اطلاعاتی همردیف شدند. قطعات ژن NCBI با ژنهای مربوطه از Lr و 21 Lr1 ،Lr ها نشان داد. ژنهای 35 RGA و NBS-LRR های بترتیب با ژنهای Lr و 10 Lr شباهت داشتند. ژنهای 29 ،agp و 2 I به ترتیب با ژن ساکارز سنتاز نوع Lr و 51 Lr های 47 که مسئول بهارهسازی در گندم زمستانه VRN وتوالی ژن 1 Lr و توالیهای ریزماهواره شباهت نشان دادند. بین ژن 39 ACC-1 است، شباهت 88 درصد وجود داشت. نتایج بدست آمده از همردیف کردن توالیها و گروه بندی آنها، حاکی از وجود تغییرات ساختاری و تنوع نوکلئوتیدی در بین ارقام بود. برخی از توالیها در بعضی از ژنها فقط از نظر چند نوکلئوتید در بین ارقام تفاوت ها جهت شناسایی ارقام حساس و مقاوم SNP نشان دادند که میتوان از آن ها برای طراحی آغازگرهای اختصاصی مبتنی بر استفاده کرد.

Keywords:

گندم نان , ژنهای مقاومت به بیماری