بررسی بیوانفورماتیکی ناحیه پروموتر ایزوفرمهای مختلف ژن NHXدر آرابیدوپسیس و برنج
Publish place: 7th national biotechnology congress of I.R. iran
Publish Year: 1390
Type: Conference paper
Language: Persian
View: 717
This Paper With 7 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
Export:
Document National Code:
NBCI07_0481
Index date: 20 September 2015
بررسی بیوانفورماتیکی ناحیه پروموتر ایزوفرمهای مختلف ژن NHXدر آرابیدوپسیس و برنج abstract
آنتی پورترهای Na+/H+ذخیره سدیم به درون واکویل و خروج سدیم از سلول را سبب میشوند، که دو فرایند عمده در کاهش غلظت سمی سدیم در سیتوپلاسم و تنظیم اسمزی سلول میباشند که برای تحمل به تنش شوری ضروریاند. در موجودات مختلف ایزوفرمهای متفاوتی از آنتی پورترهای Na+/H+گزارش شده است. حضور ایزوفرمهای مختلف آنتی پورترهای Na+/H+در سلولهای حیوانی با الگوی ویژه بیان اندامک-اختصاصی و بافت-اختصاصی و قرارگیری درون سلولی آنها ارتباط دارد. با این وجود چندگانگی ایزوفرمهای آنتی پورترهایNa+/H+ در گیاهان اخیراٌ موضوع تحقیقات شده است. در این مطالعه پروموتور 8 ایزوفرم مختلف آنتی پورترNa+/H+در آرابیدوپسیس و 4 ایزوفرم مختلف در برنج با استفاده از سایت Plant Care آنالیز شدند و عناصر تنظیمی موجود در پروموتر ایزوفرمهای مختلف با یکدیگر مقایسه شدند. همچنین الگوی بیان این ایزوفرمها در گیاه با استفاده از دادههای میکرواری درGenevestigatorبررسی شدند. نتایج آنالیز پروموتور نشان داد که تعداد متنوعی عناصر تنظیمی با نقشهای متفاوت در پروموتر ژنهایNHX وجود دارد که بیان کننده دخیل بودن این ژنها در مسیرهای مختلف فیزیولوژیک در گیاه میباشد. بررسیپروموتر نشان داد که ایزوفرمAtNHX5 فاقد عنصر تنظیمیABREمیباشد که نقش این عنصر تنظیمی در پاسخ بهABA میباشد. در تمام ایزوفرمهای موجود در آرابیدوپسیس، بیان ژن در مراحل انتهایی رشد نسبت به مراحل ابتدایی افزایش یافت. جالب این بود که ژنAtNHX1 در تمام مراحل رشدی نسبت به دیگر همولوگها بیشتر بیان شد و همراه با رشد گیاه بیان این ژن نیز افزایش یافت تا اینکه در مرحله غلاف بالغ بیشترین بیان را نشان داد. بررسی بیان ژن تحت شرایط مختلف نشان داد کهAtNHX3در حضورABAبیانش افزایش مییابد در حالیکه بیان ژنAtNHX4 کاهش یافت. بیان ژنAtNHX2 در پاسخ بهگرما افزایش یافت در حالیکه بیانAtNHX4 هم در پاسخ به گرما و هم شوری، کاهش یافت. در تنش اکسیداتیو ژنAtNHX3 کاهش بیان داشت. در تنش خشکی بیان ژنAtNHX8 به طور فاحشی افزایش یافت ولی بیان ژنAtNHX4 کاهش یافت. دربرنج میزان بیان همه ایزوفرمها در مرحله زایشی افزایش یافت. میزان بیان ژنOsNHX5 در همه مراحل رشدی نسبت به دیگر ایزوفرمهای این ژن در برنج بیشتر بود.
بررسی بیوانفورماتیکی ناحیه پروموتر ایزوفرمهای مختلف ژن NHXدر آرابیدوپسیس و برنج Keywords:
آنتی پورترNa+/H+بیوانفورماتیک- آرابیدوپسیس - برنج
بررسی بیوانفورماتیکی ناحیه پروموتر ایزوفرمهای مختلف ژن NHXدر آرابیدوپسیس و برنج authors
فرشته بیات
استادیارگروه اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه خلیج فارس
اسماعیل ابراهیمی
دانشیارگروه اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز
پریسا آقاگل زاده
دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز
سولماز احمدیان
مربی دانشگاه پیام نور واحد شهر قدس تهران
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :