بررسی تنوع ژنتیکی جدایه های R. iranicus و Rathayibacter tritici عامل خوشه صمغی گندم در استانهای اصفهان و خوزستان و با استفاده از ERIC-PCR

طی سالهای 82 -81 نمونه های دارای علائم خوشه صمغی از مزارع گندم استانهای اصفهان (شهرستانهای مبارکه، لنجان و شهر بابک) و خوزستان (اهواز، دزفول و ایرانشهر) صورت گرفت. از کشت بذور آلوده روی محیطهای YNA و NAS باکتریهایی با کلنی زرد رنگ انتخاب و خالصسازی گردیدند. جدایههای بهدست آمده، مورد بررسی های فنوتیپی و الکتروفورز پروتئین محلول سلولی 1 قرار گرفتند. جدایهها بر اساس خصوصیات فنوتیپی و الگوی پروتئین های سلولی در دو گروه قرار گرفتند. بر اساس این خصوصیات، دو گونه متعلق به جنس Rathayibacter شناسایی شدند. جدایههای استان خوزستان با جدایه استاندارد R. tritici یک گروه و جدایههای استان اصفهان به همراه جدایه استاندارد R. iranicus گروه دیگر را تشکیل دادند. برای تعیین ارتباط نسبی ژنتیکی جدایه ها DNA ژنومی استخراج و در واکنش زنجیرهای پلیمراز با آغازگرهای ERIC و 2 ERIC1R بهکار برده شد. محصول تکثیر شده در ژل آگارز 5 درصد الکتروفورز و با اتیدیوم بروماید رنگآمیزی گردید. از ضریب تشابه ژاکارد 2 برای تعیین تشابه جدایه ها و از برای آنالیز خوشهای استفاده شد. آنالیز خوشهای نتایج بهدست آمده با NTSYS-pc و نرمافزار UPGMA روشنشان داد که جدایهها در سطح تشابه 48 درصد به 2 گروه و در سطح تشابه 80 درصد به 5 گروه تقسیم ERIC-PCR عامل خوشه صمغی R. tritici و R. iranicus شدند، که نشانگر وجود تنوع ژنتیکی بالا در بین جدایههای دو گونه گندم میباشد.

Keywords:

ERIC-PCR , R. iranicus , R. tritici , خوشه صمغی , تنوع ژنتیکی