بازسازی و تجزیه و تحلیل شبکه ژنی تحمل به خشکی در برنج( Oryza sativa L. )
Publish place: 8th national biotechnology congress of I.R. Iran & 4th National Conference on biosecurity
Publish Year: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 731
This Paper With 5 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NBCI08_0531
تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394
Abstract:
برنج یکی از ارزشمندترین محصولات از لحاظ اقتصادی و اجتماعی است. خشکی نیز مهم ترین تنش و محدودیت برای کاهش پتانسیل عملکرد این گیاه می باشد. نظر به پیچیدگی و چند ژنی بودن تحمل به خشکی دراین تحقیق سعی شده است تا با گرد آوری تمامی ژن های شناخته شده دخیل در تحمل به خشکی در برنج، شبکه ژنی درگیر بازسازی شده و تصویر روشن تری از نحوه پاسخ دهی گیاه برنج به تنش خشکی و ژن های کلیدی مربوطه حاصل شود. در مجموع 133ژن شناسایی شد و شبکه برهم کنش پروتئینی برای آن ها رسم گردید. با استفاده از 12 الگوریتم محاسباتی Cytohubbaدر نرم افزار Cytoscape تمامی گره ها (Node) با بیشترین ارتباط (Edge) به دست آمد. این امر منجر به شناسایی 58 گره (ژن) غیر تکراری شد که به عنوان موثرترین ژن ها در این بین در نظر گرفته شده و شبکه ژنی مربوطه رسم شد. نتایج نشان داد که عوامل رونویسی بیشترین تعداد را در بین 58 ژن موثر داشتند. این امر نشان دهنده اهمیت این ژن ها درمکانیسم تحمل به خشکی می باشد. امید است نتایج به دست آمده در راستای یافتن راهکارهایی هدفمند جهت افزایش تحمل به خشکی مفید واقع گردد.
Keywords:
Authors
احسان پورعابد
بخش بیوانفورماتیک، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران
زهرا سادات شبر
بخش بیوانفورماتیک، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :