طراحی آغازگرهای اختصاصی ISSR چند شکلی جهت بررسی توالیهای ژنی زیر واحدهای گلوتنینی تیپهای X و y جایگاه ژنومی 1D کنترل کننده کیفیت مطلوب نانوایی در لاینهای موتانت اصلاحی گندم نان

یکی از صفات مورد توجه در اصلاح کیفی گندم نام، ارزش نانوایی است . پرولامین های گلوتن ، کیفیت آرد گندم برای فرایندهای تکنولوژیکی مختلف نظیر تهیه نان را تعیین می کند. در بین پروتئین های گلوتنین، گروه گلوتنین با وزن مولکولی بالا و بویژه الل a جایگاه ژنومی 1D با زیر واحدهای تیپهای y,x (5+10) در کیفیت نانوایی بیشترین اهمیت را دارند. در این بررسی، توالیهای اسید آمینه ای زیر واحدهای (5, 2, 2x, 2,1,2,2)x و زیر واحدهای (12,10)y مربوط به جایگاه ژنومی 1D از سایت NCBI جستجو، استخراج و با استفاده از نرم افزار Genedoc با هم مقایسه و همردیف گردیند و مشخص شد که در این زیر واحدها کمبودها، بیشبودها و موتاسیون ها نقطه ای تاثیر گذار بر عملکرد بیولوژیکی پروتئین ها اتفاق افتاده است. از مهمترین موتاسیونهای بیشبود و کمبود، بیشبود توالی 185 اسید آمینه ای زیر واحد x2.2x و توالی 102 اسید آمینه ای زیر واحد x2.2 در موقعیت 486 توالی اسید آمینه ای و حذف توالی شش اسید امینه ای IGQGQQ در موقعیت 203 زیر واحد y10 بودند و ا زموتاسیون های نقطهای مهم نیز می توان به تبدیل اسید امینه سرین به سیستئین در موقعیت 118 زیر واحد x5 و تبدیل اسید آمینه گلوتامین به هیستدین در موقعیت 626 زیر واحد x5 اشاره نمود. نهایتا، بر اساس شباهتها و اختلافات موجود در توالیهای زیر واحدهای تبپهای y,x آغازگرهای تکنیک ISSR چند شکل در موتیف های تکراری طراحی گردید. این آغازگرها در لاینهای موتانت اصلاحی برتر، ارقام تجاری استانداردو جمعیتهای F2 حاصل از تلافیهای چند شکلی باندی خوبی نشان دادند.

Keywords:

همردیف کردن , اسید آمینه , موتاسیون , DPGAE , زیر واحد , گلوتنین , ISSR , کیفیت نانوایی و گندم