شناسایی و گروه بندی خانواده عوامل رونویسی WRKYدر جو
Publish Year: 1394
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 493
This Paper With 14 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
Export:
Document National Code:
JR_GEB-4-1_004
Index date: 2 July 2017
شناسایی و گروه بندی خانواده عوامل رونویسی WRKYدر جو abstract
تنش های زیستی و غیرزیستی از مهمترین عوامل محدودکننده عملکرد گیاهان زراعی مانند جوهستند. عوامل رونویسی در تنظیم ژنهای پاسخ دهنده به این تنش ها دخالت دارند که خانوادهژنی WRKYرمز کننده گروه بزرگی از آنهاست. بنابراین شناسایی و مطالعه این خانواده ژنیمیتواند گامی موثر برای ایجاد تحمل به تنش ها در گیاهان باشد. در پژوهش حاضر، دانستنی هایمربوط به اعضای خانواده WRKYجو از پایگاه های داده جمع آوری شدند. با انتخاب یک عضواز هر زیر گروه ژنهای WRKYدر برنج، tBLASTNدر پایگاه داده های IBSCو NCBIانجامشد تا اعضای احتمالی دیگر این خانواده نیز اضافه شدند. بر اساس مدل مخفی مارکوف، جستجوبرای توالی های دارای منطقه حفاظت شده WRKYعلیه همه پروتیین های این خانواده و هر زیرگروه آنها انجام شد. اعضای پیدا شده که شامل 96عضو و یک توالی از هر زیرگروه عواملرونویسی WRKYاز گیاهان آرابیدوپسیس، برنج و گندم بودند، به صورت چندگانه هم ردیفشده و درخت فیلوژنتیک آنها رسم شد. توالی های موجود بر مبنای تعداد پهنه های WRKYوساختار انگشت روی موجود در سه گروه دسته بندی شدند. بر این اساس 13پروتیین در گروه 30،Iپروتیین با ساختار انگشت روی Cx7Cx23HxCدر گروه IIIو بقیه پروتیین ها با ساختار انگشتروی Cx4-5Cx22-23HxH در گروه IIقرار گرفتند. با توجه به نقش گروه IIIدر تحمل گیاه بهتنش های زیستی و غیر زیستی، فزونی درصد حضور اعضای این گروه در جو همانند گندم نسبت بهمیانگین گیاهان عالی را میتوان با مضاعف شدگی در اجداد وحشی تک لپه ای ها و انتخاب طبیعیبرای ارقام مقاومتر در شرایط نامساعد محیطی در ارتباط دانست
شناسایی و گروه بندی خانواده عوامل رونویسی WRKYدر جو Keywords:
شناسایی و گروه بندی خانواده عوامل رونویسی WRKYدر جو authors
بنیامین یزدانی
دانشجوی دکتری
رسول اصغری زکریا
دانشیار، دانشگاه محقق اردبیلی، اردبیل، ایران
زهرا سادات شبر
استادیار، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویجکشاورزی، کرج، ایران