بررسی EST های گندم در برهمکنش با قارچ بیمارگر Mycosphaerella graminicola
Publish place: Journal of agricultural biotechnology، Vol: 7، Issue: 2
Publish Year: 1394
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 593
This Paper With 20 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
Export:
Document National Code:
JR_JOAGK-7-2_006
Index date: 10 June 2019
بررسی EST های گندم در برهمکنش با قارچ بیمارگر Mycosphaerella graminicola abstract
در این مطالعه، 10438 EST که در پایگاه NCBI در رابطه با تعامل گندم و بیمارگر Mycosphaerella graminicola (فرم غیرجنسی Zymoseptoria tritici) ثبت شده بودند، استخراج شدند. پروتئینهای غیر تکراری و مرتبط با EST ها در بانک اطلاعاتی NCBI توسط نرم افزار SEQtoolsبه دست آمدند. این پروتئین ها بر اساس نوع، طبقه بندی شده و در 279 گروه قرار گرفتند. سپس در سایتKEGG ، مسیر 112 عدد از این پروتئینها تجزیه و تحلیل و 55 مسیر شناسایی و ارتباط بین این مسیرها و پاسخهای دفاعی گندم مورد بررسی قرار گرفت. در ادامه این مسیرها بر اساس عملکرد گروهبندی شده و در هشت گروه عملکردی (شامل پروتئینهای دفاعی، پروتئینهای درگیر در فرایند انرژی سلولی، پروتئینهای درگیر در فرایند متابولیسم سلولی، پروتئینهای درگیر در فرایند پردازش پروتئینها، پروتئینهای درگیر در فرایند پردازش RNA، پروتئینهای درگیر در چرخههای سلولی، پروتئینهای درگیر در تخریب پروتئینها و پروتئینهای درگیر در فرایند سیگنالدهی سلولی) قرار گرفتند. مسیرهای متابولیکی تثبیت کربن در فرایند فتوسنتز و پروتئینهای درگیر در فرایند دفاعی به ترتیب با دارا بودن 745 و 251 EST، در مرتبه اول و دوم قرار داشتند.. سپس نقش ESTها مخصوصا آنهایی که در مسیرهای دفاعی گیاهی درگیر بودند به صورت موردی مطالعه شدند و عملکرد آنها در مسیر دفاع گیاه گندم مشخص شد. با استفاده از اطلاعاتی که این بررسی در اختیار قرار می دهد میتوان ژنهای دیگری که به طور مستقیم و همچنین غیر مستقیم در فعالیتهای دفاعی گیاهی شرکت میکنند، مورد بررسی قرار داد.
بررسی EST های گندم در برهمکنش با قارچ بیمارگر Mycosphaerella graminicola Keywords:
بررسی EST های گندم در برهمکنش با قارچ بیمارگر Mycosphaerella graminicola authors
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :