مقایسه ی بیوانفورماتیکی بخشی از ژن پرولاکتین بین غاز و مرغ

هدف از این پژوهش بررسی بیوانفورماتیکی بخشی از ژن پرولاکتین و مقایسه ی آن بین مرغ و غاز میباشد. پرولاکتینیک هورمون پلی پپتیدی تک زنجیرهای است که که متعلق به خانواده ی هورمون رشد می باشد و در مهره داران از هیپوفیزترشح می شود. در گونه های پرندگان پرولاکتین یک هورمون حیاتی در القاء و تداوم رفتار جوجه کشی است. به منظور بررسیژن پرولاکتین (PRL) تعداد 9 توالی مربوط به دو گونه مرغ و غاز از بانک ژن NCBI اخذ شد و با استفاده از نرم افزارMEGA 6 داده های مزبور همتراز گردید و درخت فیلوژنتیکی ترسیم شد. برای تجزیه و تحلیل هاپلوتیپ ها، فاصله هایژنتیکی، تنوع نوکلئوتیدی، متوسط تعداد تفاوت های نوکلئوتیدی (K) از نرم افزار DnaSP5 استفاده شد. شبکه روابطهاپلوتایپی در گونه ها نیز با استفاده از نرم افزار Network ترسیم گردید. نتایج حاصل از آنالیز توالی های ثبت شده درNCBI برای ژن پرولاکتین منجر به شناسایی 5 هاپلوتیپ شد و به ترتیب تنوع هاپلوتیپی و تنوع نوکلئوتیدی 0/8056 و0/0349 در گونه های مورد مطالعه تعیین شد. آزمون تاجیما D مثبت به دست آمد ولی از نظر آماری تفاوت معنی دارینشان نداد که نشان از اندازه ی ثابت جمعیت دارد.

Keywords:

پرولاکتین , مرغ , غاز , آنالیز , MEGA