بازسازی شبکه‌های ژنی دخیل در پاسخ به تنش خشکی درگیاه جو

سابقه و هدف: با توجه به اهمیت تنش خشکی و نظر به اینکه تحمل به تنش خشکی صفتی چند ژنی می­باشد، هدف پژوهش حاضر بازسازی شبکه ژنی درگیر و شناسایی ژن‌های کلیدی دخیل در تنش خشکی درگیاه جو با استفاده از تجزیه و تحلیل داده‌های ریزآرایه و همچنین شناسایی فرایندهای موثر بوده است. مواد و روش­ها: تمامی ژن‌های دارای بیان افتراقی (≤ 5/2 و≥ 5/2-) در بین تمامی آزمایشات ریزآرایه انجام شده ، با استفاده از نرم‌افزار Genevestigator شناسایی شدند. ترسیم شبکه برهم‌کنش پروتئینی و شناسایی ژن­های کلیدی با استفاده از نرم‌افزار Cytoscape و بررسی هستی شناسی ژن­ها بوسیله نرم افزار AgriGO صورت گرفت. یافته ها: نتایج بدست آمده از بازسازی شبکه برهم‌کنش پروتئینی منجر به شناسایی 14 و 15 ژن کلیدی دخیل در تنش خشکی به ترتیب در مرحله نموی رویشی و زایشی شد.  بحث: بر­اساس نتایج بدست آمده، از موثرترین ژن­های کلیدی دخیل در تحمل به تنش خشکی می­توان به ژن­های عوامل رونویسی ARF1، ABF3، DREB1A، DREB2A،HY5  و  HYHاشاره کرد.  نتیجه گیری: بررسی هستی شناسی ژن­های پاسخ­دهنده به خشکی و هاب روشن ساخت که تنظیم فرایندهای زیستی، فرایندهای متابولیسمی، کنترل دوره نوری و فتوسنتز و همچنین تنظیم زمان گلدهی از مهم­ترین فرآیندهای تاثیر گذار بر این تنش می­باشند.

بازسازی شبکه‌های ژنی دخیل در پاسخ به تنش خشکی درگیاه جو Keywords:

Barley , Drought stress , Biological network , Hub genes , گیاه جو , تنش خشکی , شبکه‌های زیستی , ژن هاب