تنوع ملکولی و روابط ژنتیکی بین توده های Aegilops tauschii بر اساس چندشکلی حاصل از ناحیه CAAT-box پروموتر ژن ها

Publish Year: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 351

This Paper With 20 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-13-1_003

تاریخ نمایه سازی: 11 مرداد 1400

Abstract:

هدف:  اهمیت خویشاوندان وحشی در به نژادی گندم سبب شده است تا مطالعات فراوانی در رابطه با بررسی تنوع و ساختار ژنتیکی گونه های مختلف گندم وحشی با استفاده از سیستم های نشانگری گوناگون انجام شود. هدف این مطالعه بررسی تنوع ژنتیکی ۹۰ توده مختلف tauschii Ae. به منظور تعیین میزان تنوع ژنتیکی، و همچنین آنالیز ساختار ژنتیکی آن ها برای گروه بندی توده ها با استفاده از چند شکلی حاصل از نواحی CAAT-box   بود.  مواد و روش ها: در این تحقیق تنوع ژنتیکی و ساختار جمعیت ۹۰ توده Ae. tauschii جمع­آوری شده از مناطق مختلف ایران با استفاده از ۱۲آغازگر CBDP مورد بررسی قرار گرفت. نتایج: با توجه به نتایج به دست آمده در مجموع، تعداد ۱۴۱ باند توسط ۱۲ آغازگر مورد استفاده تولید شد که ۹۱ مورد از این باندها چندشکل بودند و متوسط تعداد باند چند شکل تولید شده به ازای هر آغازگر برابر با  ۵۸/۷ بدست آمد. مقدار شاخص محتوای اطلاعات چند شکل(PIC) و شاخص نشانگر (MI) برای آغازگرهای CBDP مورداستفاده بترتیب بین ۴/۰ تا ۴۹/۰ و ۴۹/۱ تا ۹۹/۴ متغیر بود. با توجه به شاخص های محاسبه شده آغازگرهای CB۹، CB۱۲ و CB۱ بیشترین کارایی را در تفکیک ژنتیکی توده ها نشان دادند. تجزیه ساختار ژنتیکی، توده های مورد بررسی را در سه گروه اصلی با  تعداد ۱۰، ۱۸ و ۳۰ توده دسته بندی نمود و بقیه توده ها به عنوان توده های مخلوط شناسایی شدند.  در این مطالعه بالاترین مقادیر شاخص های تنوع ژنتیکی شامل تعداد آلل های موثر، شاخص شانون و میزان هتروزیگوسیتی مربوط به زیر جمعیت ۱ بود. علاوه بر این، میزان تمایز ژنی (Gst) و جریان ژنی (Nm) بین زیر جمعیت ها به ترتیب برابر با ۰۳/۰ و ۵۸/۱۸ بود. دندروگرام حاصل از تجزیه خوشه ای، توده های مورد بررسی را به سه گروه تقسیم بندی نمود که مطابق با گروه بندی حاصل از تجزیه ساختار ژنتیکی بود. نتیجه گیری: نتایج حاصل از پارامترهای مختلف نشان داد که نشانگر CBDP یک نشانگر مناسب در بررسی تنوع ژنتیکی توده های Aegilops tauschii  می باشد. همچنین با توجه به نتایج ساختار ژنتیکی جمعیت و پارامترهای تنوع ژنتیکی بین زیر جمعیتی به نظر می رسد لازم است  اقداماتی جهت حفاظت از این منبع ژنتیکی ارزشمند که توان بالقوه بسیار بالایی در بهنژادی گندم زراعی دارد، صورت گیرد. 

Authors

عاطفه نوری

دانشگاه آزاد اسلامی واحد خوراسگان

علیرضا اطمینان

گروه بیوتکنولوژی و به نژادی گیاهی، واحد کرمانشاه، دانشگاه آزاد اسلامی، کرمانشاه، ایران

مریم گل آبادی

دانشیار گروه زراعت و اصلاح نباتات، واحد اصفهان (خوراسگان)، دانشگاه آزاد اسلامی، اصفهان، ایران

علی اشرف مهرابی

گروه اصلاح و بیوتکنولوژی دانشگاه ایلام

عبدالمجید رضایی

استاد گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد اصفهان (خوراسگان)، اصفهان، ایران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • بهادر یاسر؛محمدآبادی محمدرضا؛خضریامین؛اسدی مهدیه؛مدحتی لیلا (۱۳۹۵) مطالعهتنوعژنتیکیجمعیتهایزنبورعسلاستانکرمانبااستفادهازنشانگرهای ISSR. پژوهش هایتولیداتدامی۱۳(۱)، ...
  • پورابوقداره علیرضا؛ اطمینان علیرضا؛ شوشتری لیا؛ ملکی تبریزی ندا (۱۳۹۸) ...
  • Ahmadi J, Pour-Aboughadareh A, Fabriki-Ourang S, Mehrabi A-A, Siddique KHM ...
  • Ahmadi J, Pour-Aboughadareh A, Ourang SF, Mehrabi AA, Siddique KHM ...
  • Anderson JA, Churchill GA, Autrique JE, et al. (۱۹۹۳) Optimizing ...
  • Bahador Y, Mohammadabadi MR, Khezri A, Asadi M, Medhati L ...
  • Bansal M, Kaur S, Dhaliwal HS, Bains NS, Bariana H ...
  • Benoist C, O'hare K, Breathnach R, Chambon P (۱۹۸۰) The ...
  • Cheniany M, Ebrahimzadeh H, Salimi A, Niknam V (۲۰۰۷) Isozyme ...
  • Colmer TD, Flowers TJ, Munns R (۲۰۰۶) Use of wild ...
  • Doyle JJ, Doyle JL (۱۹۸۷) A rapid DNA isolation procedure ...
  • Dubcovsky J, Dvorak J (۲۰۰۷) Genome plasticity a key factor ...
  • Dulai S, Molnár I, Szopkó D et al. (۲۰۱۴) Wheat- ...
  • Dumolin-Lapegue S, Demesure B, Fineschi S, Le Corre V, Petit ...
  • Ebrahimi Z, Mohammadabadi MR, Esmailizadeh A, Khezri A (۲۰۱۵) Association ...
  • Eltaher S, Sallam A, Belamkar V, Emara HA, Nower AA, ...
  • Etminan A, Pour-Aboughadareh A, Mohammadi R et al. (۲۰۱۸a) Applicability ...
  • Etminan A, Pour-Aboughadareh A, Noori A et al. (۲۰۱۸b) Genetic ...
  • Giraldo OP (۲۰۱۹) Political ecology and agriculture. ۱st Edition, Springer, ...
  • Hamidi H, Talebi R, Keshavarzi, F (۲۰۱۴) Comparative efficiency of ...
  • Kahiluoto H, Kaseva J, Balek J, et al. (۲۰۱۹) Decline ...
  • Khodabakhshzadeh R, Mohammadabadi MR, Moradi H et al. (۲۰۱۵) Identify ...
  • Liu B, Martre P, Ewert F, et al. (۲۰۱۸) Global ...
  • Liu W, Rouse M, Friebe B, et al. (۲۰۱۱) Discovery ...
  • Lopes M, El-Basyoni I, Baenziger P, Singh S, Royo C, ...
  • Mahjoob BH, Najafi-Zarini and Hashemi SHR (۲۰۱۴) Assessment of genetic ...
  • Mayer KFX, Rogers J, Dole el J, et al (۲۰۱۴) ...
  • Moazeni SM, Mohammadabadi MR, Sadeghi M et al. (۲۰۱۶) Association ...
  • Moghadaszadeh M, Mohammadabadi MR, Esmailizadeh Koshkoieh A (۲۰۱۵) Association of ...
  • Moghaddam M, Ehdaie B, Waines G. ۲۰۰۰. Genetic diversity of ...
  • Moradkhani H, Mehrabi A, Etminan A, Pour-Aboughadareh A (۲۰۱۵) Molecular ...
  • Moradkhani H, Pour-Aboughadareh AR, Mehrabi AA, Etminan A (۲۰۱۲) Evaluation ...
  • Mousavifard SS, Saeidi H, Rahiminejad MR, Shamsadini M (۲۰۱۵) Molecular ...
  • Naghavi M, Maleki M, Tabatabaei S (۲۰۰۹) Efficiency of floristic ...
  • Naghavi MR, Hajikaram M, Taleei AR, Jafar Aghaee M (۲۰۱۰) ...
  • Nei M (۱۹۷۸) Estimation of average heterozygosity and genetic distance ...
  • Olivera PD, Rouse MN, Jin Y (۲۰۱۸) Identification of new ...
  • Olson EL, Rouse MN, Pumphrey MO, et al. (۲۰۱۳) Introgression ...
  • Petersen G, Seberg O, Yde M, Berthelsen K (۲۰۰۶) Phylogenetic ...
  • Pont C, Salse J (۲۰۱۷) Wheat paleohistory created asymmetrical genomic ...
  • Pour-Aboughadareh A, Ahmadi J, Mehrabi AA, et al. (۲۰۱۷a) Assessment ...
  • Pour-Aboughadareh A, Ahmadi J, Mehrabi AA, Moghaddam M, Etminan A ...
  • Pour-Aboughadareh A, Etminan A, Shooshtari L, Maleki-Tabrizi N (۲۰۱۹) Comparative ...
  • Prevost A, Wilkinson MJ (۱۹۹۹) A new system of comparing ...
  • Pritchard JK, Stephens M, Donnelly P (۲۰۰۰) Inference of population ...
  • Putman AI, Carbone I (۲۰۱۴) Challenges in analysis and interpretation ...
  • Saeidi H, Rahiminejad MR, Vallian S, Heslop-Harrison JS (۲۰۰۶) Biodiversity ...
  • Salse J, Chagué V, Bolot S, et al. (۲۰۰۸) New ...
  • Singh AK, Rana MK, Singh S, et al. (۲۰۱۴) CAAT ...
  • Sohail Q, Shehzad T, Kilian A, et al. (۲۰۱۲) Development ...
  • Tahernezhad Z, Zamani MJ, Solouki M, Zahravi M, Imamjomeh AA, ...
  • Vajed Ebrahimi MT, Mohammad Abadi MR, Esmailizadeh AK (۲۰۱۶) Analysis ...
  • Varshney RK, Chabane K, Hendre PS, et al. (۲۰۰۷) Comparative ...
  • Wang IJ (۲۰۱۳) Examining the full effects of landscape hetero-geneity ...
  • Yan W, Li J, Zheng D, Friedman C, Wang H, et al. (۲۰۱۹) Analysis of genetic population structure and diversity in Mallotus ...
  • Zhuravlev YN, Reunova GD, Kats IL, Muzarok TI, Bondar AA ...
  • نمایش کامل مراجع