بررسی پروفایل بیان ژنی سلولهای مزانشیمی مغز استخوان بیماران مبتلا به لنفوم فولیکولار

سلولهای بنیادی مزانشیمی (MSC) سلولهای چندتوان هستند که توانایی خودنوزایی و تمایز به انواع سلولهای مختلف ، ترمیم بافت و تنظیم سیستم ایمنی را دارند. لنفوم فولیکولار (FL)یک نئوپلاسم سیستمیک بافت لنفاوی است که از تکثیر سلول B ایجاد می شود که تحت تاثیر ریزمحیط تومور و سلولهای استرومایی مزانشیمی قراردارد. به نظر میرسد تنظیم مکانیسم مولکولی مربوط به لنفوم فولیکولار به عنوان یک رویکرد جدید برای کنترل بیماری مفید باشد.در مطالعه صورت گرفته داده های میکرواری GSE۸۵۲۲۹ شامل گروه کنترل سلولهای مزانشیمی مغز استخوان انسان و گروه تیمار سلولهای مزانشیمی مغز استخوان از بیماران مبتلا به لنفوم فولیکولار را از پایگاه داده GEO انتخاب کردیم. DEG ها با GEO۲R (با مقادیر p values <۰.۰۵ و logFC│≥۱.۵ بررسی شدند. از پایگاه داده Enrichr به منظور هستی شناسی ژن ها((GO مانند فرایندهای بیولوژیکی، اجزا سلولی و عملکرد مولکولی استفاده شد. پایگاه های داده KEGG، ChEA و MiRTarBase به ترتیب برای بدست آوردن مسیرهای سیگنالینگ، فاکتور های رونویسی(( TF و میکرو ارانای((microRNA ژنهای up استفاده شد. آنالیزهای صورت گرفته نشان میدهد DEG ها شامل )۲۴۰ژن (up و ۲۰۸ (ژن(down می باشند. نتایج حاصل از GO برای ژنهای up نشان میدهد که این ژنها در فرآیند بیولوژیکی مانند همانندسازی DNA، تفکیک کروماتید خوا هری میتوزی، فرآ یند متا بو لیسم DNA ن قش دارند. چرخه سلو لی، مسیر سیگنالینگ p۵۳ ، عفونت ویروس ۱ لوسمی سلول T انسانی مهمترین مسیرهای مرتبط با ژن های up هستند.FOXM۱ ، E۲F۴ ، ARوE۲F۷ برترین TFها هستند که ژن های up را کنترل می کنند. آنالیزmicroRNAها نشان داد که برترین microRNAهای مرتبط با ژنهای up شامل hsa-miR-۱۹۳b-۳p،hsa-miR-۲۱۵-۵p و hsa-miR-۱۹۲-۵p میباشند. کنترل مکانیسمهای مولکولی سلولهای بنیادی مزانشیمی ممکن است برای کنترل لنفوم فولیکولار مفید باشد.

Keywords:

بیوانفورماتیک , میکرواری , فاکتور رونویسی , میکرواران ای