تعیین خصوصیات فنوتیپی و تنوع ژنتیکی جدایه های Pseudomonas syringae pv. syringae عامل شانکر باکتریایی درختان میوه هسته دار در استان های خراسان رضوی و شمالی

حمیده احسنی; سعید نصراله نژاد; حشمت اله رحیمیان; جواد محمودی صفا

تعیین خصوصیات فنوتیپی و تنوع ژنتیکی جدایه های Pseudomonas syringae pv. syringae عامل شانکر باکتریایی درختان میوه هسته دار در استان های خراسان رضوی و شمالی

Publish place: Plant pests and diseases، Vol: 87، Issue: 2

Publish Year: 1398

Type: Journal paper

Language: Persian

This Paper With 13 Page And PDF Format Ready To Download

DOWNLOAD Paper

Certificate
I'm the author of the paper

این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

کشاورزی > شانکر باکتریایی

Export:

Link to this Paper:

https://civilica.com/doc/1516255

Document National Code:

JR_JAEN-87-2_004

Index date: 13 September 2022

تعیین خصوصیات فنوتیپی و تنوع ژنتیکی جدایه های Pseudomonas syringae pv. syringae عامل شانکر باکتریایی درختان میوه هسته دار در استان های خراسان رضوی و شمالی abstract

باکتری Pseudomonas syringae pv. syringae (Pss)عامل یکی از بیماری های شایع در باغ های درختان میوه هسته دار می باشد. به منظور شناسایی جدایه های عامل بیماری، طی سال های ۱۳۹۱-۱۳۹۰، ۲۳ جدایه به دست آمده از باغ های درختان میوه هسته دار واقع در مناطق مختلف استان های خراسان رضوی و شمالی از نظر فنوتیپی (فیزیولوژیکی و بیوشیمیایی) و بیماری زایی مورد بررسی قرار گرفتند. جدایه ها از نظر ویژگی های فنوتیپی اختلافات جزئی نشان دادند. همه جدایه ها روی هلو و بادام دارای قدرت بیماری زایی بالایی بودند و از این نظر مشابه به نظر رسیدند. صحت تشخیص جدایه ها در سطح گونه توسط واکنش زنجیره ای پلیمراز و با استفاده از آغازگر های D۲۱/D۲۲ اختصاصی گونه مورد تایید قرار گرفت. تنوع ژنتیکی جدایه ها به دو روشrepetitive element palindromic PCR (rep-PCR) و با استفاده از آغازگر های BOXA۱R، ERIC۱R و ERIC۲ و روش Insertion Sequence PCR (IS-PCR) و با استفاده از آغازگر IS۵۰ مورد بررسی قرار گرفت. آنالیز خوشه ای نتایج به دست آمده نشان داد که در BOX-PCR با آغازگر BOXA۱Rدر سطح تشابه ۷۵ درصد، جدایه ها به ۷ گروه؛ در ERIC-PCR با آغازگر ERIC۱R در سطح تشابه ۶۵ درصد، جدایه ها به ۷ گروه و با آغازگر ERIC۲ در سطح تشابه ۵۶ درصد، جدایه ها به ۸ گروه؛ در IS-PCR با آغازگر IS۵۰ در سطح تشابه ۵۲ درصد، جدایه ها به ۱۱ گروه و در نهایت با ترکیب هر چهار آغازگر در سطح تشابه ۵۴ درصد جدایه ها به ۷ گروه قابل تفکیک هستند. نتایج بیانگر تنوع ژنتیکی بالا درون جدایه های عامل بیماری شانکر باکتریایی درختان میوه هسته دار در استان های مورد مطالعه است.

تعیین خصوصیات فنوتیپی و تنوع ژنتیکی جدایه های Pseudomonas syringae pv. syringae عامل شانکر باکتریایی درختان میوه هسته دار در استان های خراسان رضوی و شمالی Keywords:

شانکر باکتریایی , تنوع ژنتیکی , درختان میوه هسته دار , rep-PCR , IS-PCR

تعیین خصوصیات فنوتیپی و تنوع ژنتیکی جدایه های Pseudomonas syringae pv. syringae عامل شانکر باکتریایی درختان میوه هسته دار در استان های خراسان رضوی و شمالی authors

حمیده احسنی

گروه گیاه پزشکی، دانشکده تولید گیاهی، دانشگاه علوم کشاورزی ومنابع طبیعی گرگان، گرگان، ایران

سعید نصراله نژاد

دانشیار گروه گیاهپزشکی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان

حشمت اله رحیمیان

استاد گروه گیاهپزشکی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ساری، ایران

جواد محمودی صفا

گروه گیاه پزشکی، دانشکده تولید گیاهی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان، ایران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :

ABBASI, V., RAHIMIAN, H. and TAJICK-GHANBARI, A., ۲۰۱۳a. Identification and ...

ABBASI, V., RAHIMIAN, H. and TAJICK-GHANBARI, A., ۲۰۱۳b. Genetic variability ...

AGRIOS, G.N., ۲۰۰۵. Plant pathology. ۵th ed. Elsevier Academic Press ...

ARABI, F., NIKRAVESH, Z., BABAEIZAD, V., REZAEIAN, V. and RAHIMIAN, ...

BAHAR, M., MOJTAHEDI, H. and AKHYANI, A., ۱۹۸۲. Apricot bacterial ...

BANAPUR, A., ZAKAI, Z. and AMANI, G., ۱۹۸۹. Isolation of ...

BERG, D.E. and HOWE, M.M., ۱۹۸۹. Mobile DNA. Washington. D.C: ...

BULTREYS, A. and KALUZNA, M., ۲۰۱۰. Bacterial cankers caused by ...

DAWSON, S.L., FRY, J.C. and Dancer, B.N., ۲۰۰۲. A comparative ...

GILBERT, V., LEGROS, F., MARAITE, H., and BULTREYS, A., ۲۰۰۹. ...

GONZALEZ, A.I., PEREZ, D.E. L.A. VEGA, M., RUIZ, M.L. and ...

KANG, H.P. and DUNNE, W.M., ۲۰۰۳. Stability of repetitive-sequence PCR ...

KENNELLY, M.M., CAZORLA, F.M., VICENTE, A., RAMOS, C. and SUNDIN, ...

LITTLE, E.L., BOSTOCK, R.M. and KIRKPATRIC, B.C., ۱۹۹۸. Genetic characterization ...

LOUWS, F.G., FULBRIGHT, D.W., STEPHANS, C.T. and BRUJIN, F.G., ۱۹۹۴. ...

LOUWS, F.G., RADEMARKER, J.L.W. and BRUIJN, F.J., ۱۹۹۹. The three ...

MAHILLON, J. and CHANDLER, M., ۱۹۹۸. Insertion sequences. Microbiology and ...

MAJD, A. and SHARIATZADEH, M.A., ۲۰۱۵. Molecular cell biology. Ayiizh ...

MANCEAU, C. and HORVAIS, A., ۱۹۹۷. Assessment of genetic diversity ...

MENARD, M., SUTRA, L., LUISETTI, J., PRUNIER, J.P., and GARDAN, ...

MILGROOM, M.G. and FRY, W.E., ۱۹۹۷. Contribution of population genetics ...

MOHAMADNIA, A., BAHRAMI, N., TASHAKOR, A., JAHANBAZI, A. and VAZIRITABAR ...

MOSIVAND, M., RAHIMIAN, H. and SHAMS-BAKHSH, M., ۲۰۰۹. Phenotypic and ...

NAJAFI POUR, G. and TAGHAVI, M., ۲۰۱۱. Comparison of Pseudomonas ...

PALACIO-BIELSA, A., CAMBRA, M.A. and LOPEZ, M.M., ۲۰۰۹. PCR detection ...

PALLERONI, N.J., ۲۰۰۵. Genus Ӏ. Pseudomonas. Pp. ۳۳-۳۷۹ In: Brenner ...

ROHLF, F.J, ۱۹۹۰. NTSYS-pc. Numerical taxonomy and multivariat analysis system, ...

ROOS, I.M. and HATTINGH, M.J., ۱۹۸۷. Systematic invasion of plum ...

SCHAAD, N.W., JONES, J.B., and CHUN, W., ۲۰۰۱. Laboratory guide ...

THOMIDIS, T., TSIPOURIDIS, C., EXADAKTYLOU, E. and DROGOUDI, P., ۲۰۰۵. ...

VERSALOVIC, J., SCHEIDER, M., BRUIJN, F.J. and LUPSKI, J.R., ۱۹۹۴. ...

VICENT, J.G., ALVES, J.P., RUSSELL, K. and ROBERTS S.J., ۲۰۰۴. ...

VICENT, J.G. and ROBERTS, S.J., ۲۰۰۷. Discrimination of Pseudomonas syringae ...

WEINGART, H. and VOLKSCH, B., ۱۹۹۷. Genetic fingerprinting of Pseudomonas ...

WOLSKA, K., SZWEDA, P., LADA, K., RYTEL, E., GUCWA, K., ...

نمایش کامل مراجع