پویش ژنومی برای شناسایی نواحی تحت انتخاب در زنبورهای عسل نژاد کارنیکا و قفقازی

زنبور عسل ،گرده افشان کلیدی محصولات کشاورزی است . رفتار زنبور عسل یکی از معیارهای انتخاب در زنبورداری ها می باشد که در کنار تولید عسل مناسب ، جزء مهمترین صفات در این صنعت به شمار می رود. با در نظر گرفتن این دو صفت ، زنبورهای عسل نژاد کارنیکا و قفقازی جزء نژادهای کارآمد به ح ساب می آیند. رشد تصاعدی تولید دادههای ژنومی در سالهای اخیر باعث شده است تا مطالعات گوناگونی بر پایه این اطلاعات، طراحی و اجرا شود. یکی از حوزههای جذاب در این زمینه ، شناسایی نواحی تحت انتخاب در ژنوم موجودات مختلف می باشد. این روش، یکی از راهبردهای مناسب جهت یافتن ژنهای کاندیدا برای صفات مهم اقتصادی محسوب می شود. در این مطالعه از روش Fst برای شنا سایی قطعه های کروموزومی تحت انتخاب (دارای تمایز ژنتیکی ) در ژنوم زنبورهای عسل نژاد کارنیکا و قفقازی ، استفاده شد. برای این منظور، دادههای ژنومی ۲۹ نمونه زنبور نر کارنیکا و ۱۴ نمونه زنبور نر قفقازی از سایت NCBI دانلود شد. پس از پالایش کیفی دادهها و طی مراحلی برای شناسایی واریانت ها ژنومی ، آماره Fst برای واریانت های نهایی محاسبه شد. نتایج بدست آمده نشان داد که تعدادی از نواحی تحت انتخاب در دو نژاد، با ژنهای مربوط به ادراک حس بویایی مرتبط هستند.

Keywords:

دادههای ژنومی , قفقازی , کارنیکا , نشانه انتخاب