پویش جامع ژنومی برای شناسایی نواحی ژنومی مرتبط با صفات فیزیولوژی و زراعی در گندم نان تحت شرایط تنش خشکی
Publish place: Journal of agricultural biotechnology، Vol: 15، Issue: 4
Publish Year: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 80
This Paper With 20 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JOAGK-15-4_002
تاریخ نمایه سازی: 5 دی 1402
Abstract:
هدف: خشکی یکی از مهم ترین تنش های محیطی است که بر رشد و نمو گندم تاثیر منفی می گذارد. این مطالعه به منظور تعیین ساختار جمعیت و شناسایی نشانگرهای پیوسته با صفات فیزیولوژی و زراعی در گندم نان در شرایط تنش خشکی انجام شد.مواد و روش ها: ۲۳۸ ژنوتیپ مختلف گندم نان در قالب طرح بلوکهای کامل تصادفی با دو تکرار در شرایط تنش خشکی مورد ارزیابی قرار گرفتند. صفات فیزیولوژی از جمله تبادل دی اکسید کربن، سرعت فتوسنتز و میزان کلروفیل و صفات مختلف زراعی شامل روز تا سنبلهدهی، روز تا رسیدگی، طول و عرض برگ پرچم، ارتفاع بوته، وزن دانه در بوته، تعداد دانه در واحد سطح، عملکرد دانه و عملکرد بیولوژیک اندازهگیری شدند. تعیین ژنوتیپ با استفاده از آرایه چند شکلی تک نوکلئوتیدی(SNP) با تراکم ۹K در شرکت TraitGenetic کشور آلمان صورت گرفت. تجزیه ساختار جمعیت با استفاده از ۱۷۰۹۳ نشانگر SNP و در محیط R انجام شد. تجزیه ارتباطی بین دادههای فنوتیپی و نشانگرهای SNP با استفاده از نرم افزار TASSEL و روش مدل خطی عمومی (GLM) انجام شد. نتایج: بر اساس تجزیه ساختار جمعیت، ۲۳۸ ژنوتیپ گندم در ۵ زیرگروه تقسیم بندی شدند. در مجموع ۱۳۲ ارتباط نشانگر-صفت (MTAs) برای صفات مختلف شناسایی شدند. از این بین چهار SNP، بر روی کرموزوم های ۶B، ۴A، و ۶A با صفات تعداد دانه در واحد سطح، وزن دانه و عملکرد اثر پلیوتروپیک داشتند. تعداد هشت MTA برای وزن دانه بر روی کروموزومهای ۴B، ۵B، ۶B و ۷A شناسایی شد. بیشترین تعداد SNP بر روی کروموزوم ۶B قرار داشتند که ناحیه ای را در فاصله ۵۱۹-۴۸۱ مگا جفت باز پوشش دادند. برای تعداد دانه در واحد سطح نیز دوازده MTA بر روی کروموزومهای ۳B، ۴A، ۵A، ۶A و ۶B مکانیابی شدند. که بیشترین تعداد SNP در فاصله ۵۶۱-۴۹۲ مگا جفت باز و بر روی کروموزوم ۶B قرار داشتند. این ناحیه از کرموزوم ۶B با ناحیه شناسایی شده برای وزن دانه در بوته نیز همپوشانی داشت، که نشاندهنده اهمیت این ناحیه از ژنوم گندم در بهبود عملکرد گندم نان می باشد.نتیجه گیری: نتایج حاصل از این تحقیق به طور بالقوه به اصلاح کنندگان در بهبود افزایش پتانسیل عملکرد گندم کمک می کند. از نشانگرهای شناسایی شده میتوان در برنامه های انتخاب به کمک نشانگر استفاده کرد.
Keywords:
Authors
ملیحه رحیمی صادق
دانشجوی کارشناسی ارشد ژنتیک و به نژادی گیاهی، گروه تولید وژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنرکرمان، کرمان، ایران.
سمیه ساردویی نسب
استادیارژنتیک و به نژادی گیاهی، پژوهشکده فناوری تولیدات گیاهی، دانشگاه شهید باهنرکرمان، کرمان، ایران.
قاسم محمدی نژاد
استاد ژنتیک و به نژادی گیاهی، گروه تولید وژنتیک گیاهی، پژوهشکده فناوری تولیدات گیاهی، دانشگاه شهید باهنرکرمان، کرمان، ایران. رایانامه
شکوفه خاندانی
دانشجوی دکترای رشته ژنتیک و به نژادی گیاهی، گروه ژنتیک و به نژادی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :