بررسی بیوانفورماتیک بیان ژن های KAT2 و KAT1 تحت تنش شوری در گیاه آرابیدوبسیس
Publish place: 12th Congress of Iranian Genetics Society
Publish Year: 1391
Type: Conference paper
Language: Persian
View: 1,353
This Paper With 5 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
Export:
Document National Code:
CIGS12_0756
Index date: 25 January 2014
بررسی بیوانفورماتیک بیان ژن های KAT2 و KAT1 تحت تنش شوری در گیاه آرابیدوبسیس abstract
روزنه ها نقش مهمی در انتقال آب و دی اکسید کربن به گیاه دارند. باز و بسته شدن روزنه ها می تواند تحت تأثیر عوامل متعددی از جمله تنش شوری قرار گیرد. مشخص شده که دو پروتئین KAT1 و KAT2 بیشترین نقش را در ساختار و عملکرد سلول های نگهبان و کنترل تنش شوری دارند. بیان ژن KAT1 به منزله یک مسیر برای ورود پتاسیم و بازشدن روزنه ها و مهار فعالیت کانال KAT1 باعث بسته شدن روزنه ها می شود. به منظور مقایسه بیان ژنهای مذکور در حالت طبیعی و تحت تنش شوری و دربازه های زمانی متفاوت، از سایت (bbc.botany.utoronto.ca) e-FP Browser استفاده شد. به منظور بررسی هم بیانی ژن ها از الگوی رونویسی mRNA-Mrna و برهم کنش پروتئین- پروتئین استفاده و آانالیز داده ها با نرم افزار Minor calculation bug fix of ver. c4.0. از سایت مذکور انجام شد. بررسی الگوی هم بیان دو ژن KAT1 و KAT2 در ساقه نشان می دهد که الگوی بیان این ژن مشابه هم بوده ولی میزان بیان ژن KAT1 همواره از ژن KAT2 بیشتر است. در اندام ریشه بیان آنها کاملاً متفاوت بوده و ژن KAT2 نسبت به KAT1 بیان بیشتری دارد. با درنظر گرفتن این مسئله که هر دو ژن عملکرد مشابه دارند می توان گفت که KAT2 برای اندام ریشه و KAT1 برای اندام هوایی تمایز یافته است.
بررسی بیوانفورماتیک بیان ژن های KAT2 و KAT1 تحت تنش شوری در گیاه آرابیدوبسیس Keywords:
بررسی بیوانفورماتیک بیان ژن های KAT2 و KAT1 تحت تنش شوری در گیاه آرابیدوبسیس authors
مصطفی حق پناه
دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات- پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری طبرستان، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی ساری
قربانعلی نعمت زاده
استاد گروه زراعت و اصلاح نباتات- پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری طبرستان، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی ساری
سیده فرزانه فاطمی
دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات- پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری طبرستان، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی ساری