بررسی تنوع میکروبی آب معدن کرومیت فرومد در استان سمنان به روش متاژنومیکس

هدف: آگاهی از الگوی تنوع م کیروبی معادن از اهمیت قابل توجهی ایبرخوردار است چرا که م کیروارگانیسم ها واسطه بسیاری از فرایندهایمحیطی هستند و کاربرد بیوتکنولوژیک فراوان دارند.از آنجایی کهشناسایی کامل م کیروارگانیسم ها به دلیل غیر قابل کشت بودنشان بهروش کلاسکی امکان پذیر نیست،در این طرح به روش متاژنوم کیستنوع م کیروبی محیط اطراف معدن کرومیت فرومد بررسی شد که کیی ازاهداف آن دسترسی به تنوع حقیقی م کیروبی میباشد.روش: نمونه برداری از نه منطقه مختلف معدن انجام و پس از استخراجDNA ، با تکثیر ژن 16SrRNA با پرایمرهای اختصاصی و کلونینگمحصول PCR در حامل پلاسمیدی،کتابخانه ژنی 16SrRNA ساختهشد. کلون های حاوی DNA خارجی غربالگری و بوسیله PCR حضور16srRNA تا یید شد. سپس از هر کتابخانه ژنی تعدادی کلون بصورتتصادفی انتخاب و تع یین توالی شدند که قرابت آنها با م کیروارگانیسم هایشناخته شده از طریق مقایسه با توالی های ثبت شده در بانک اطلاعاتیزیستی بررسی شد.نتیجه: ویرایش و مقایسه توالی ها با داده های موجود در پایگاه ملی اطلاعاتزیستی) NCBI ( حضور جنس های، Enterobacter،PolaromonasCedecea، Rheinheimera،Bradyhizaboium، Runella،Curibacter، Flavobacterrium، HydogenophagaPseudomonas، Algoriphagus، Limnobacter، Rubrimonas،Thermosynechococcus، Porphyrobacter، Bosea وPseudoxanthomonas در آبهای معدن را نشان داد.بحث:مقایسه نتایج حاصل با مطالعات مشابه نشان داد که جنسهای Flavobacterrium، Pseudomonas، Rheinheimera وBradyhizaboium در معادن دیگر نیز گزارش شده است. سایرجنسهای باکتریائی شناسائی شده در سایر معادن گزارش نشده استکه ممکن است به دلیل اینکه شرائط زیستی خاص این معدن از جملهقلیایی بودن آب معدن کرومیت در مقایسه با PH اسیدی تا خنثی بودناکثر معادن مورد بررسی باشد. از طرفی علیرغم تراکم جمعیت م کیروبینسبتاً کم، تنوع م کیروبی مشاهده شده آبهای معدن بیشتر از تنوع گزارششده در مطالعات قبلی است که نشان دهنده تنوع و غنای زیستی محیطزیست کشور و نیاز به توسعه این نوع مطالعات برای شناخت بیشتر آنهااست.

Keywords:

تنوع میکروبی , متاژنومیکس , ژن 16srRNA , معدن کرومیت