تجزیه و تحلیل in silico برهمکنش گندم و قارچ بیمارگر Zymoseptoria tritici
Publish place: 12th Congress of Iranian Genetics Society
Publish Year: 1393
Type: Conference paper
Language: Persian
View: 769
This Paper With 5 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
Export:
Document National Code:
CIGS13_0198
Index date: 27 January 2015
تجزیه و تحلیل in silico برهمکنش گندم و قارچ بیمارگر Zymoseptoria tritici abstract
دراین بررسی، همه ESTهایی که در سایتNCBIدر رابطه با تعامل گندم و بیمارگرZymoseptoria triticiثبت شده بودند، استخراج شدند. تعداد آن ها بالغ بر 10438 بود. سپس پروتئینهای غیر تکراری و مرتبط باESTها در بانک اطلاعاتیNCBIتوسط نرم افزارSeqtoolsبه دست آمدند. این پروتئین ها بر اساس تشابه نام طبقه بندی و در 279 گروه قرار گرفتند. با جستجو در سایتKEGG 112 عدد از این پروتئینها دارای مسیر بودند و در مرحله بعد، ارتباط بین این مسیرها و پاسخهای دفاعی گیاه گندم مورد بررسی قرار گرفت.در ادامه این مسیرها بر اساس عملکرد گروهبندی و در هشت گروه عملکردی قرار گرفتند. گروههای عملکردی شامل 1 - پروتئینهایدفاعی 2 - پروتئینهای دخیل در فرایند انرژی سلولی 3- پروتئینهای دخیل در فرایند متابولیسم سلولی 4- پروتئینهای دخیل در فرایند پردازش پروتئینها 5 - پروتئینهای دخیل در فرایند پردازشRNA6 - پروتئینهای دخیل در چرخههای سلولی 7- پروتئینهای دخیل درتخریب پروتئین ها و 8- پروتئینهای دخیل در فرایند سیگنالدهی سلولی بودند
تجزیه و تحلیل in silico برهمکنش گندم و قارچ بیمارگر Zymoseptoria tritici Keywords:
تجزیه و تحلیل in silico برهمکنش گندم و قارچ بیمارگر Zymoseptoria tritici authors
جلال غلام نژاد
دانشجوی دوره دکتری بیماریشناسی گیاهی، دانشگاه تربیت مدرس)
فروغ سنجریان
استادیار پژوهشگاه ملی مهندسی ژنیک و زیست فناوری)
ابراهیم محمدی گل تپه
استاد دانشکده کشاورزی دانشگاه تربیت مدرس، بخش بیماریشناسی گیاهی
ناصر صفایی
دانشیار دانشکده کشاورزی دانشگاه تربیت مدرس، بخش بیماریشناسی گیاهی
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :