تجزیه و تحلیل توالیهای غیرترجمه شونده اعضای خانواده عوامل رونویسی AP2/ERFدر گندم
Publish place: 12th Congress of Iranian Genetics Society
Publish Year: 1393
Type: Conference paper
Language: Persian
View: 768
This Paper With 5 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
Export:
Document National Code:
CIGS13_0295
Index date: 27 January 2015
تجزیه و تحلیل توالیهای غیرترجمه شونده اعضای خانواده عوامل رونویسی AP2/ERFدر گندم abstract
تنشهای غیر زیستی سبب کاهش قابل توجه رشد و عملکرد گیاهان میشوند. خانواده AP2/ERFیک خانواده بزرگ از عواملرونویسی است که در پاسخ به تنشهای غیرزیستی نقش دارد. تنظیم بیان ژن در مرحله ترجمه براساسخصوصیات مولکولmRNAتعیین میشود که یکی ازمهمترین آنها نواحی غیرترجمه شوندهUTR هستند. در این مطالعه ویژگیهای نواحیUTR خانواده AP2/ERFدرگندم (شامل 136 عضو)، بر اساسروشهای بیوانفورماتیکی بررسی شد. بر اساس نتایج، میانگین طول ناحیهUTR-5 کمتر و محتوایGC آن بیشتر از ناحیهUTR-3 بود. موقعیت 4+ در % 60 از اعضا توسط گوانین و موقعیت 3 - نیز در بیشتر توالیها توسط نوکلئوتیدهای پورینی65/93درصداشغال شده بود. بیشترین تعداد کدون آغاز بالادستuATG 9 عدد) درTaAP2-1 بدست آمد. توالیUTR-5چهارژنTaAP2- و 14 TaAP2-9 ،TaAP2-2 ،TaERF-B4-9 دارای ناحیهای برای اتصال ریبوزوم، مستقل از کلاهک5IRES بودند. سه توالی هدف برای miRNAدر اعضا خانواده TaAP2ERFشناسایی شد که شامل یک توالی هدف درTaDREB-A6-1) 5´-UTRودوتوالی هدف درTaDREB-A1- و 17 TaDREB-A1-16) 3´-UTRبود. سه عنصر سیس LTRCOREATCORE15 20 جایگاه PROXBBNNAPAپنج جایگاه) وERELEE4 یک جایگاه) نیز به صورت اختصاصی فقط در توالی UTR-5′- اعضا این خانواده مشاهده شد.
تجزیه و تحلیل توالیهای غیرترجمه شونده اعضای خانواده عوامل رونویسی AP2/ERFدر گندم Keywords:
تجزیه و تحلیل توالیهای غیرترجمه شونده اعضای خانواده عوامل رونویسی AP2/ERFدر گندم authors
فرزان قانع گل محمدی
گروه زیست شناسی سیستمها، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، کرج، ایران
زهراسادات شبر
گروه زیست شناسی سیستمها، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، کرج، ایران
احسان پورعابد
گروه زیست شناسی سیستمها، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، کرج، ایران
خدیجه مظفری
گروه زیست شناسی سیستمها، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، کرج، ایران
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :